16S rRNA分析（待续）

一，参考https://mp.weixin.qq.com/s/-wHeBieibPPQ2OPBvcj41Q来进行分析

1，首先是理论部分：

参考https://mp.weixin.qq.com/s/G3Wl0kmC4nJDIk07I1SoHA

所以大概是扩增1个1.5kb左右的gene序列，然后做的大概是微生物分类以及系统发育分析之类的工作。

所以本质上是宏基因组分析，就是获取环境样品中总DNA中的16S rRNA部分gene序列，然后做一个系统发生分析。

然后大致的流程就是：

另外分析角度上，一般是和

代谢组以及宏基因组分析相关：

2，开始数据分析：测序数据处理和质量控制

参考https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkwNTY1ODMwMw==&mid=2247485293&idx=1&sn=58e9c45f1b75aa4fd94cfe55457930a9&chksm=c0f52dbdf782a4abc25aeb36445f912e3f3b398772cbdf50a3c5f7bd81a6acbf362181c71dae&cur_album_id=3403570134298935299&scene=189#wechat_redirect

2种分析策略以及方法：

（1）数据库使用上：

https://docs.qiime2.org/2024.5/