课程特色:
1. 小班授课,招收36名学员,方便指导每个学员;
2. 五天时间,包含R语言基本介绍,扩展包安装,数据转换,R语言绘图,利用R分析RNAseq数据,WGCNA分析,TCGA分析等内容;
3. 准备大量案例,通过远程访问Rstudio与本地端运行,能够顺利运行每个案例;
4. 以完整项目为案例,通过亲自上手操作,快速掌握技能,五天完成1万行代码;
5. 赠送32G优盘,含有大量生物信息学习资料,可继续巩固学习;
6. 赠送一年生物云服务器(32线程,256G,24T)使用权限,可分析自己数据;
7. 赠送100页以上纸质版讲义一份。
培训信息
特邀讲师团队:基因学苑王通老师
培训时间:2019年5月11-15日,9:00-17:30
培训地点:杭州江干区6号大街260号正泰中自科技园19幢2楼大会议室
注意:小班教学,本次仅招生36人哦~
主讲老师:王通
曾任职于华大基因,9年以上生物信息分析经验,擅长基因组,转录组,宏基因组,肿瘤基因组等数据分析。
2015年开始创业,主要做生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者,已制作视频500集以上。
首创视频+云服务器培训模式,目前已在北京,深圳,哈尔滨,杭州,武汉,南京,长春,广州,青岛等组织过多场培训班,线上线下累计学员超过4000多名。公众号“基因学苑”作者,已写作生物信息教程150多篇。
课程安排:(根据现场情况适当调整进度)
日期 | 主题 | 课程安排 |
第1天 (上午) | R语言基础与文件操作 | 一R语言基础 1.1 R语言简介 1.2 R软件安装 1.3 Rstudio软件安装和使用 1.3 Rstudio 设置 1.4 设置工作目录 1.5 R函数 1.6 安装R包 1.7 Bioconductor介绍 1.8 获取帮助 1.9 R语言个性化设置 1.10常用快捷键 1.11 常见错误 |
第1天 (下午) | R语言数据结构 | 二文件操作 2.1 手动输入数据 2.2 读入文件 2.4 写入文件 2.5 读写excel文件 2.6 访问数据库 三R语言数据结构 3.1 内置数据集 3.2 向量 3.3 矩阵 3.4 列表 3.5 数据框 3.6 因子 3.7 缺失数据 3.8 时间序列 |
第2天 (上午) | 数据索引与操作 | 四数据索引及操作(重点) 4.1 数据索引 4.2 筛选过滤 4.3 排序sort与order 4.4 分组统计 4.5 数据合并与拆分 4.6 tidyr与dplyr |
第2天 (下午) | 统计检验与数据挖掘 | 五统计检验 5.1 零假设检验 5.2 频数统计与独立性检验 5.3 t检验与wilcox检验 5.4相关性检验 六R语言数据挖掘 6.1线性回归 6.2基因组大小与基因个数线性回归 6.3购物篮分析 6.4用户收听习惯分析, 6.5 利用机器学习预测乳腺癌 |
第3天 (上午) | R语言绘图 | 七R语言与生物信息绘图 7.1 R语言绘图系统介绍 7.2 高级绘图与低级绘图 7.3 绘图参数 7.4 绘图函数包 7.5分组条形图 |