MDMIL复现

提供数据结构：C16：训练集：

测试集：

标签格式类似于这样，提供测试集的标签列表。

同时可以在对应代码中调整数据目录格式：

超参数：

--data_dir:数据目录。给予按上面格式创建好的根目录。

--p1和--p2:用于实现模型选取前k个关键实例来做计算。

注意给的参数不要带引号，否则地址目录也会带引号导致识别不到正确路径。

报错处理：

 1.表示模型没有forward:在dsmil.py文件中模型中def forward需要往右整体移动一个Tab。

2.计算AUC时，报错提醒y_true需要包含两种标签：原因是未正确提供标签格式，如果标签是0、1，那么提供标签格式不是字符‘1’。

3.在使用TCGA数据集时，出现feats的值变成nan的错误

这个问题源于MDMIL在选取前k个关键实例的时候，模型原本按前p1或p2的数据来选取，若WSI过小，只有几十个实例的时候，若p为0.1则k<1，即这种情况下一个关键实例都没有选择，在计算关键实例特征时就会得到nan，因为前0个实例的特征均值无法计算。为了解决nan报错，添加代码保证选取实例数大于等于1就行。