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原创 seqtk批量抽取reads
有些时候样本里面的reads数存在差异,有的几十万条,有的几万条,这个时候通常用seqkit进行抽取。面对多个样本需要处理的情况可用。按比例抽取(0.6)
2023-04-26 15:39:15
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原创 python——基本绘图
颜色选取颜色选取可以根据下图选择(颜色是可以直接用英文表示:red,blue……)英文大小写都可以。颜色表链接画图散点图coding=utf-8import matplotlib.pyplot as plt#简单散点图(scatte)years = [2012, 2013, 2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019, 2020, 2021, 2022]peoples = [100, 200, 300, 400, 500, 600, 800, 1025, 160
2022-03-30 12:56:45
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原创 R语言排序
sort()函数是对向量进行从小到大的排序rank()函数返回的是对向量中每个数值对应的秩order()函数返回的值表示位置,依次对应的是向量的最小值、次小值、第三小值……最大值等(位置索引)arrange()函数(需加载dplyr包)针对数据框,返回基于某列排序后的数据框,方便多重依据排序转载:R语言学习笔记:sort、rank、order、arrange排序函数 - Hider1214 - 博客园 (cnblogs.com)https://www.cnblogs.com/hider/p/
2022-03-25 11:07:41
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原创 【python拆分fasta文件为多个小的fasta文件】
#将fasta拆分N份import sysimport pandas as pdimport os#这里我写了一个判断参数,这里输入参数:fa文件,拆分数,输出文件夹if len(sys.argv)>3 and len(sys.argv)<5: fasta=sys.argv[1] #读取文件 n=sys.argv[2] #分成数 n=int(n) out_file = sys.argv[3] #路径#判断目录是否存在,不存在创建 if no.
2022-03-23 14:51:36
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空空如也
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