R语言STAMP-丰度差异比较图

代码来源：

(1条消息) R语言完美重现STAMP结果图_刘永鑫Adam的博客-CSDN博客

先看一下STAMP软件中的丰度差异比图的参数有那些

看到上面的P值过滤条件是选择0.05,最重要的是上面有一个多次矫正方法选择，软件里面是没有选择的，代码是有选择的

唯一要做调整的就是平均丰度低于1%，STAMP软件没有做这样的调整。

后面根据代码得到的结果图，不难看出结果存在一定的偏差

其实我最开始用STAMP软件，没有选择显著性检验方式，结果显示的是九个，选择后就是七个，但是后面重新导入文件的时候，结果就一直是九个，后面发现是没有进行校正，选择一样的P值校正方式，结果是一样的，不过软件的精确度保存不同。

仔细看这里要选择跟代码一样的校正方式

代码编写的程序要方便很多，尤其是在做多组分析的时候，不用像软件要一个一个保存。