Docker 基本操作

重要操作

# 进入镜像
docker run --rm -it -v /home/(存放文件的文件夹):/work 521b9a3e60ed
# --rm 退出镜像后删除容器(container)
# -it 交互式进入容器
# -v 将某一文件夹下目录映射到 docker /work 工作目录
# 最后加上选择进入的镜像 ID
# -w 加默认进入目录

常见命令

docker search blast (或者加一些 docker hub 上传的镜像) 
# 搜索 blast 相关的镜像或者搜查 docker hub 上相关用户的提供的镜像
docker pull # 下载镜像
docker images # 查看镜像
exit # 退出

高级命令

docker ps # 查看后台运行中的镜像
docker logs + container ID # 查看容器运行日志
docker attach + ID # 前提是容器还在运行状态下
docker exec -it + ID bash # 交互式执行一个命名，此处为进入容器 (更多的是使用该条命令进入容器)
# 这里加 bash 是让容器新开一个 bash 终端，可以不加，有些是默认的

不进入容器使用工具

docker run --rm -v D:/samtools/:/work -w /work biocontainers/samtools:latest samtools faidx dna-sequences.fasta
# 不用交互式进入，直接放入容器运行