K-means算法实战项目（Python实现）

旅途中的宽~

已于 2022-07-28 21:11:23 修改

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分类专栏：机器学习系列文章文章标签： python 算法 kmeans 机器学习聚类

于 2022-07-28 20:27:59 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/wzk4869/article/details/126040866

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在进行讲解之前，先放出数据集：

链接：https://pan.baidu.com/s/1y2hUqXm5-LsLpDqrMK3bIQ
提取码：6666

1.K-means算法

K-means算法为一种无监督学习算法，可以实现算法自动区分数据集中不同簇。

无监督学习区别于监督学习算法，无监督学习中没有标签y，算法需要根据输入的数据集直接将其进行区分为各簇，每簇数据有其聚类中心。

K-means 算法是一种自动将相似数据示例聚类在一起的方法。具体来说，给你一个训练集 $x^{(1)}；\cdots; x^{(m)}$ (其中 $x^{(i) }\in R^n$ )，并且想要将数据分组到几个有凝聚力的“簇”中。

K-means 背后是一个迭代过程，首先猜测初始聚类中心，然后通过重复将示例分配给它们最接近的聚类中心，然后根据分配重新计算聚类中心来重新猜测。

K-means算法的伪代码如下：

算法步骤总结如下：

1.随机选取k个聚类中心点

2.遍历所有数据，将数据划分到最近的那个聚类中心点

3.计算所有类的平均值，作为新的聚类中心点

4.重复步骤2和步骤3，直到聚类中心点不再发生变化，或者达到设定的迭代次数

计算每个样本点到聚类中心的距离为：

计算新的聚类中心点：

2.给定一个二维数据集，利用k-means聚类

导入运算包：

import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.io import loadmat
import matplotlib as mpl

导入需要的数据集

def load_dataset():
    path='./data/ex7data2.mat'
    # 字典格式 : <class 'dict'>
    data=loadmat(path)
    # data.keys() : dict_keys(['__header__', '__version__', '__globals__', 'X'])
    dataset = pd.DataFrame(data.get('X'), columns=['X1', 'X2'])
    return data,dataset

如同上面所讲，我们此时导入的数据是字典格式，关于如何使用Python导入mat格式的数据并整理成DataFrame格式的问题，我在之前的文章中也有讲解，欢迎大家学习：

https://blog.csdn.net/wzk4869/article/details/126018725?spm=1001.2014.3001.5501

我们可以简单看一下输出结果:

首先是data

{'__header__': b'MATLAB 5.0 MAT-file, Platform: GLNXA64, Created on: Wed Nov 16 00:48:22 2011', '__version__': '1.0', '__globals__': [], 'X': array([[ 1.84207953,  4.6075716 ],
       [ 5.65858312,  4.79996405],
       [ 6.35257892,  3.2908545 ],
       [ 2.90401653,  4.61220411],
       [ 3.23197916,  4.93989405],
       [ 1.24792268,  4.93267846],
......中间省略部分数据集
       [ 4.8255341 ,  2.77961664],
       [ 6.11768055,  2.85475655],
       [ 0.94048944,  5.71556802]])}

接下来是dataset

           X1        X2
0    1.842080  4.607572
1    5.658583  4.799964
2    6.352579  3.290854
3    2.904017  4.612204
4    3.231979  4.939894
..        ...       ...
295  7.302787  3.380160
296  6.991984  2.987067
297  4.825534  2.779617
298  6.117681  2.854757
299  0.940489  5.715568

数据可视化

拿到数据集后，我们可以可视化一下，看一下数据集的样子：

def plot_scatter():
    data,dataset=load_dataset()
    plt.figure(figsize=(12,8))
    plt.scatter(dataset['X1'],dataset['X2'],cmap=['b'])
    plt.show()

在这里插入图片描述
寻找数据点的最近的聚类中心

我们这一步的目标是定义函数，用于寻找数据点的最近的聚类中心。

输入参数为数据集X、初始聚类中心，返回一个一维数组，其长度与X的数据点个数相同，每个索引对应的值为该点对应的聚类中心。

def get_near_cluster_centroids(X,centroids):
    """
    :param X: 我们的数据集
    :param centroids: 聚类中心点的初始位置
    :return:
    """
    m = X.shape[0] #数据的行数
    k = centroids.shape[0] #聚类中心的行数，即个数
    idx = np.zeros(m) # 一维向量idx，大小为数据集中的点的个数，用于保存每一个X的数据点最小距离点的是哪个聚类中心
    for i in range(m):
        min_distance = 1000000
        for j in range(k):
            distance = np.sum((X[i, :] - centroids[j, :]) ** 2) # 计算数据点到聚类中心距离代价的公式，X中每个点都要和每个聚类中心计算
            if distance < min_distance:
                min_distance = distance
                idx[i] = j # idx中索引为i，表示第i个X数据集中的数据点距离最近的聚类中心的索引
    return idx # 返回的是X数据集中每个数据点距离最近的聚类中心

编写计算聚类中心函数

传入数据集X、聚类中心索引idx、聚类中心个数k。

算法根据idx将X分为k个组，每个组有多个X内的数据集，计算其平均值，得到求平均值之后的聚类中心。返回值为求一次平均值之后的聚类中心。

本函数需要传入idx数组，故不能用于直接初始化聚类中心，只起到优化聚类中心的作用。

def compute_centroids(X, idx, k):
    """
    :param X: 数据集
    :param idx: 每个样本所属的类别
    :param k: 类别总数
    :return:
    """
    m, n = X.shape
    centroids = np.zeros((k, n)) # 初始化为k行n列的二维数组，值均为0，k为聚类中心个数，n为数据列数
    for i in range(k):
        indices = np.where(idx == i) # 输出的是索引位置
        centroids[i, :] = (np.sum(X[indices, :], axis=1) / len(indices[0])).ravel()
    return centroids

K-means迭代算法

传入参数数据集X、初始化后的聚类中心、迭代次数。

每次迭代使用之前的两个函数，先计算出idx索引数组，再计算出聚类中心。

返回迭代多次后的idx和cendroids。

def k_means(X, initial_centroids, max_iters):
    """
    :param X:
    :param initial_centroids: 初始聚类中心
    :param max_iters: 迭代次数
    :return:
    """
    m, n = X.shape
    k = initial_centroids.shape[0]
    idx = np.zeros(m)
    centroids_all = []
    centroids_all.append(initial_centroids)
    centroids = initial_centroids
    for i in range(max_iters):
        idx = get_near_cluster_centroids(X, centroids)
        centroids = compute_centroids(X, idx, k)
        centroids_all.append(centroids)
    return idx, np.array(centroids_all),centroids

调用执行算法

首先，我们初始化centroids为：

centroids_0=np.array([[3, 3], [6, 2], [8, 5]])

接着我们画出聚类图像：

def plot_classify_data(X,idx):
    cluster1 = X[np.where(idx == 0)[0], :]
    cluster2 = X[np.where(idx == 1)[0], :]
    cluster3 = X[np.where(idx == 2)[0], :]
    fig, ax = plt.subplots(figsize=(12, 8))
    ax.scatter(cluster1[:, 0], cluster1[:, 1], s=30, color='r', label='Cluster 1')
    ax.scatter(cluster2[:, 0], cluster2[:, 1], s=30, color='g', label='Cluster 2')
    ax.scatter(cluster3[:, 0], cluster3[:, 1], s=30, color='b', label='Cluster 3')
    ax.legend()
    plt.show()

idx, centroids_all,centroids=k_means(X,centroids_0,10)
plot_classify_data(X,idx)

结果为：

我们想看一下聚类中心的变化情况：

def plot_data(centroids_all,idx):
    plt.figure(figsize=(12,8))
    cm=mpl.colors.ListedColormap(['r','g','b'])
    plt.scatter(dataset['X1'],dataset['X2'], c=idx,cmap=cm)
    plt.plot(centroids_all[:,:,0],centroids_all[:,:,1], 'kx--')
    plt.show()

结果为：

综上所述，结果清晰明了。

在以上操作中，使用的初始聚类中心均为自己找的聚类中心，直接以数组形式进行定义。

实际上，聚类中心应在数据集X中随机选择k个样本带你作为聚类中心。

设计初始化聚类中心函数

def init_centroids(X, k):
    m, n = X.shape
    init_centroids = np.zeros((k, n))
    idx = np.random.randint(0, m, k)
    for i in range(k):
        init_centroids[i, :] = X[idx[i], :]
    return init_centroids

我们展示一下结果：

print(init_centroids(X, 3))

[[3.12635184 1.2806893 ]
 [3.12405123 0.67821757]
 [2.84734459 0.26759253]]

可视化图像为：

for i in range(5):
    idx, centroids_all, centroids = k_means(X, init_centroids(X, 3), 10)
    plot_data(centroids_all,idx)

需要注意的是，每次运行结果都不相同，具有随机性！

完整版代码

"""
给定一个二维的数据集，使用k-means算法进行聚类
"""
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.io import loadmat
import matplotlib as mpl

"""
导入数据的函数
"""
def load_dataset():
    path='./data/ex7data2.mat'
    # 字典格式 : <class 'dict'>
    data=loadmat(path)
    # data.keys() : dict_keys(['__header__', '__version__', '__globals__', 'X'])
    dataset = pd.DataFrame(data.get('X'), columns=['X1', 'X2'])
    return data,dataset

"""
绘制散点图
"""
def plot_scatter():
    data,dataset=load_dataset()
    plt.figure(figsize=(12,8))
    plt.scatter(dataset['X1'],dataset['X2'],cmap=['b'])
    plt.show()

"""
获得每个样本所属的类别
"""
def get_near_cluster_centroids(X,centroids):
    """
    :param X: 我们的数据集
    :param centroids: 聚类中心点的初始位置
    :return:
    """
    m = X.shape[0] #数据的行数
    k = centroids.shape[0] #聚类中心的行数，即个数
    idx = np.zeros(m) # 一维向量idx，大小为数据集中的点的个数，用于保存每一个X的数据点最小距离点的是哪个聚类中心
    for i in range(m):
        min_distance = 1000000
        for j in range(k):
            distance = np.sum((X[i, :] - centroids[j, :]) ** 2) # 计算数据点到聚类中心距离代价的公式，X中每个点都要和每个聚类中心计算
            if distance < min_distance:
                min_distance = distance
                idx[i] = j # idx中索引为i，表示第i个X数据集中的数据点距离最近的聚类中心的索引
    return idx # 返回的是X数据集中每个数据点距离最近的聚类中心

def compute_centroids(X, idx, k):
    """
    :param X: 数据集
    :param idx: 每个样本所属的类别
    :param k: 类别总数
    :return:
    """
    m, n = X.shape
    centroids = np.zeros((k, n)) # 初始化为k行n列的二维数组，值均为0，k为聚类中心个数，n为数据列数
    for i in range(k):
        indices = np.where(idx == i) # 输出的是索引位置
        centroids[i, :] = (np.sum(X[indices, :], axis=1) / len(indices[0])).ravel()
    return centroids

def k_means(X, initial_centroids, max_iters):
    """
    :param X:
    :param initial_centroids: 初始聚类中心
    :param max_iters: 迭代次数
    :return:
    """
    m, n = X.shape
    k = initial_centroids.shape[0]
    idx = np.zeros(m)
    centroids_all = []
    centroids_all.append(initial_centroids)
    centroids = initial_centroids
    for i in range(max_iters):
        idx = get_near_cluster_centroids(X, centroids)
        centroids = compute_centroids(X, idx, k)
        centroids_all.append(centroids)
    return idx, np.array(centroids_all),centroids

def plot_data(centroids_all,idx):
    plt.figure(figsize=(12,8))
    cm=mpl.colors.ListedColormap(['r','g','b'])
    plt.scatter(dataset['X1'],dataset['X2'], c=idx,cmap=cm)
    plt.plot(centroids_all[:,:,0],centroids_all[:,:,1], 'kx--')
    plt.show()

def plot_classify_data(X,idx):
    cluster1 = X[np.where(idx == 0)[0], :]
    cluster2 = X[np.where(idx == 1)[0], :]
    cluster3 = X[np.where(idx == 2)[0], :]
    fig, ax = plt.subplots(figsize=(12, 8))
    ax.scatter(cluster1[:, 0], cluster1[:, 1], s=30, color='r', label='Cluster 1')
    ax.scatter(cluster2[:, 0], cluster2[:, 1], s=30, color='g', label='Cluster 2')
    ax.scatter(cluster3[:, 0], cluster3[:, 1], s=30, color='b', label='Cluster 3')
    ax.legend()
    plt.show()


def init_centroids(X, k):
    m, n = X.shape
    init_centroids = np.zeros((k, n))
    idx = np.random.randint(0, m, k)
    for i in range(k):
        init_centroids[i, :] = X[idx[i], :]
    return init_centroids

if __name__=='__main__':
    data,dataset = load_dataset()
    plot_scatter()
    X=data.get('X')
    centroids_0=np.array([[3, 3], [6, 2], [8, 5]])
    idx, centroids_all,centroids=k_means(X,centroids_0,10)
    plot_data(centroids_all, idx)
    plot_classify_data(X,idx)
    print(init_centroids(X, 3))
    for i in range(5):
        idx, centroids_all, centroids = k_means(X, init_centroids(X, 3), 10)
        plot_data(centroids_all,idx)