3D Infomax | 改进GNN + 分子性质预测
首先,可以细看下面的图,其中从对比的角度来分析了之前的GNN方法和本文提出的GNN方法的思路。3D Infomax的大致思路即,使用一个2D GNN学习序列特征,和一个3D GNN学习结构特征,然后学习两个模型输出的feature vector之间的mutation information(MI);其中,3D分子图结构是在许多任务中必需的一类数据,但目前的3D数据远远不够。因此,本文提出使用已知的3D分子数据库来预训练一个模型,基于其中的2D分子图,来推测其几何特征。
原创
2023-10-18 21:14:27 ·
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