DNA 序列实现:

一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。

给定一个很长的DNA序列,以及要求的最小子序列长度,研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。

 

import java.io.*;
 
public class Main{
    public static void main(String[] args) throws NumberFormatException, IOException{
        BufferedReader br = new BufferedReader(new InputStreamReader(System.in));
        String str;
        while((str = br.readLine()) != null){
            int maxRadio = 0;
            int index = 0;
            int n = Integer.parseInt(br.readLine());
            for(int i = 0;i <= str.length() - n;i++){
                int temp = getMaxRadio(str.substring(i,i+n));
                if(temp > maxRadio){
                    maxRadio = temp;
                    index = i;
                }
            }
            System.out.println(str.substring(index,index + n));
        }
    }
     
    public static int getMaxRadio(String str){
        int count = 0;
        for(int i = 0;i < str.length();i++){
            if('G' == str.charAt(i) || 'C' == str.charAt(i)){
                count++;
            }
        }
        return count;
    }
     
}

 

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