生信学习
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奶茶可可
这个作者很懒,什么都没留下…
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【Scanpy】单细胞转录组分析思路之细胞分类
本文将详细讲述单细胞转录组分析的步骤,包括预处理,归一化、降维,聚类和下游分析等。原创 2022-11-24 21:42:35 · 3182 阅读 · 0 评论 -
【生信学习】Scanpy函数pp.calculate_qc_metrics
函数describe_obs, describe_var,来进行对细胞、基因进行质控指标的计算。会直接返回细胞、基因两个质控指标。obs对应的是细胞,var对应的是基因。这个跟Anndata数据格式相关。以一个单细胞分析作为展示,数据集包括有2041个细胞,1020个基因。原创 2022-10-13 21:23:13 · 1944 阅读 · 0 评论