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脑电图EEG
文章平均质量分 90
sta@ma@brain
从事核磁共振脑科学研究,在Nature communications等权威期刊发表磁共振相关研究成果。熟练掌握磁共振成像数据处理方法(T1w, fMRI, dWI)和统计检验方法。本博客以记录学习中的点滴,着重记录从影像数据处理软件安装,数据处理步骤,以及分析方法(图论,矩阵理论,统计检验方法,回归分析,机器学习等),希望对志同道合的有一定的帮助。
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corrplot和ggcorrplot画热力图
corrplot的基础用法和指南corrplot包主要针对相关系数输出的结果进行可视化,可以实现选择颜色,文本标签,颜色标签,布局等的操作。语法和常用参数介绍函数语法corrplot(corr, method = c("circle", "square", "ellipse", "number", "shade", "color", "pie"), type = c("full", "lower", "upper"), add = FALSE, col = NULL, bg = "white"转载 2021-09-21 10:19:24 · 873 阅读 · 0 评论 -
如何画一个漂亮的功能连接矩阵图
下面将介绍一种画功能连接矩阵热力图的程序。该程序使用简单,有了改代码再也不用担心类似下图的矩阵热力图。以下几幅图都是来自一些神经、精神、心理学的顶级期刊,包括nature medicine,nature communications、brain等。这些图是以矩热力图的形式展示的功能连接或者统计学结果图。我们可以看到属于不同的网络的节点的连接被一些网格线分割开,很容易让别人识别脑网络。那么这种图是怎么做出来的呢?本期我们将给大家介绍一个专门用于做这种矩阵热力图的程序,并教大家如何使用改程序做出高清转载 2021-07-20 09:51:22 · 2797 阅读 · 5 评论 -
脑科学核磁共振——功能连接的常用度量方法
如图1所示,介绍一种功能连接常用度量的分类法,并简要描述每种方法的主要目的。图1. 功能连接测量的常用方法分类脑科学核磁共振——功能连接的常用度量方法计算时是否规定了功能连接的方向Pearson相关系数和互信息格兰杰因果分析、自回归模型、非参数谱矩阵分解转移熵相位同步相干系数(The Coherence Coefficient)相位斜率指数(Phase Slope Index)相干性虚部(Imaginary Part of Coherency)锁相值(Phase Locking Value)一致性相位翻译 2021-05-16 15:24:01 · 1245 阅读 · 0 评论 -
脑科学磁共振成像(MRI)初学者必看——功能脑网络、小世界网络、FDR校正、脑电信号频率变换、模板、假设检验、广义线性模型、独立成分分析、影像组学、任务态和静息态方法汇总
磁共振成像初学者必看一、浅谈功能脑网络二、不同模态脑网络的构建功能脑网络结构脑网络白质纤维束脑网络加权网络二值网络三、趣谈散点图与相关系数四、脑电信号频域变换五、fMRI中的FDR校正六、模板(mask)1、模板(mask )往往是与ROI联系在一起的2、mask作用的原理3、常见的mask七、假设检验和效果量八、组水平标准化九、由 ALFF 说开去十、计算机存取MRI影像的那些事十二、Linux基础命令十三、浅谈标准空间模板和空间变换一:标准空间模板二:空间变换十四 、 功能连接十五、大脑激活与功能连接的原创 2021-04-17 22:42:26 · 25041 阅读 · 13 评论 -
脑电信号(EEG)处理中的机器学习方法总结——回归模型,SVM、K近邻、人工神经网络、朴素贝叶斯、决策树和随机森林、集成学习、模糊逻辑、LDA线性判别分析、K-means聚类、强化学习、迁移学习
本文归纳总结了机器学习在脑电分析中的应用,并详细介绍回归模型,SVM、K近邻、人工神经网络、朴素贝叶斯、决策树和随机森林、集成学习、模糊逻辑、LDA线性判别分析、K-means聚类、强化学习、迁移学习等机器学习方法的有效性、关键特性及其最适合的应用场景。文章来源于2020年发表的《A Review on Machine Learning for EEG Signal Processing in Bioengineering》EEG机器学习方法总结A.概览B.回归模型C. SVM支持向量机D. KNN K原创 2021-01-06 19:37:32 · 3774 阅读 · 0 评论 -
网络分辨率对人类新皮层拓扑特性的影响
来源于文章 Effects of network resolution on topological properties of human neocortex创新点解剖皮质网络的拓扑组织随稀疏性和皮质尺度的分辨率而变化,提供了一种新颖的方法——基于Ledoit–Wolf 引理的最新技术来缩小协方差估计值,收缩过程对区域之间的协方差进行校正,目的是减少从回归分析得出的均方误差。摘要图论分析应用于神经影像数据集,为人类新皮质的大规模解剖组织提供了宝贵的见解。这些研究大多数以不同的皮层规模进行,从而导致原创 2021-01-06 16:19:08 · 975 阅读 · 0 评论 -
脑电图(EEG)学习资料汇总:在线视频教程、学习网站、书籍教材
由于EEG信号的分析涉及数字信号处理、概率论、统计学等多个学科的知识,这使得很多EEG初学者望而却步。这里,从在线视频教程、学习网站和书籍教材三个方面汇总目前的EEG学习素材,希望对正在EEG学习路上的朋友有所帮助。EEG学习资料汇总EEG在线视频教程EEG学习网站EEG书籍教材EEG在线视频教程1.EEGlab官方视频教程该视频共7部分,B站地址:EEGlab官方视频2.台湾國立陽明大學卢家锋教授的EEGlab视频教程B站地址:卢家锋教授的EEGlab视频教程3.ERP数据分析—基原创 2020-12-23 10:01:55 · 2632 阅读 · 0 评论