从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。

在每次开始debug之前，先在spyder的ipython界面中输入%reset 把工作空间的所有变量清除，以免影响到我们接下来的测试.（在python里，!的意思就是在当前状态下执行该python语句，这里的用法是查看变量的值）c”就会往下执行(continue)，在打“断点”的地方停住。

通常情况下，我会写一个脚本来处理数据，脚本中难免会有错误的地方，如果能记录下真实运行的命令，就能检查是否有bug存在，也便于以后查阅。可以把脚本的输出保存在stdout.log文件中，把运行过的命令保存在cmd.log中。上述三种方式都可以在执行脚本的同时，输出运行的命令，并在命令前用+标记。

先看效果图如下所示：latex中表格跨页，需要用到超级表格，常用的超级表格有 supertabular 和 longtable 宏包。下面介绍longtable 的使用。直接附上可在texlive使用的代码：\documentclass{article}\usepackage{longtable}\usepackage{geometry}\geometry{a4paper,left=2cm,right=2cm,top=2.5cm,bottom=2.5cm}\title{A longtab

如果你真的需要large caption，这是一个选择。如果禁用浮动特性，那么标题可以继续到下一页，如下所示。这里定义了一个称为fighere的新环境\makeatletter\newenvironment{figurehere}{\def\@captype{figure}}{}\makeatletter完整代码\documentclass{article}\usepackage[demo]{graphicx} <--- remove demo option for actu

mrtrix3处理DTI数据代码——DWI数据进行概率追踪和纤维素追踪DWI预处理1、数据准备被试DWI和T1数据，均放置在同一文件夹/home/hitlab/hitlab/GS/data/tt1/text下。数据类型均为 DICOM 格式。2、数据转换原理说明：DWI的DICOM数据进行格式转换成mif格式，mif格式是MRtrix自定义的格式，同时储存图像 信息，图像头文件和梯度信息。mrconvert /home/hitlab/hitlab/GS/data/tt1/text/DTI dwi

1、linux书籍和笔记可见附件中，推荐学习linux的视频为：linux初学者必看 这个视频我认为对于初学者是很好的，学习周期大概2到3天即可。2、freesurfer皮层分割的软件参考官网：FreeSurfer官方网站，这个官网详细介绍了从安装到使用的详细教材。3、freesurfer中文的安装教材推荐看我的博客：安装教材4、freesurfer同时可以看看B站的视频：视频，这个对于初学者也是很好的5、还可以看看中文的文档：中文文档...

本文是Ubuntu18.04系统上安装最新版的Freesurfer软件。以下是所有安装流程。安装过程——下载，解压freesurf，注册license文件Step1: 下载Freesurfer，该软件提供两种下载方式，第一种是直接去官网下载，地址为https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/rel7downloads.第二种就是在Ubuntu里使用命令下载：wget ftp://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/pub/dist/free

按照文所述中方法才解决。归纳一下，主要的问题在于，之前都是用 legacy 的 bios 安装，但是现在 bios 已经是 efi 了，所以用之前的方法无法正确引导。主要步骤：1. 找到一个 ubuntu 启动盘，可以用 ubuntu 创建，也可以在 windows 刻录一个 u 盘。2. U 盘启动，选择试用 ubuntu，联网。3. 执行：#sudo add-apt-repository ppa:yannubuntu/boot-repair && sudo apt-get up

Linux系统压缩和解压文件指令gzip/gunzip 指令：gzip 用于压缩文件， gunzip 用于解压的基本语法应用实例细节说明zip/unzip 指令：zip 用于压缩文件， unzip 用于解压基本语法zip 常用选项unzip 的常用选项应用实例tar 指令：打包指令，打包后的文件是 .tar.gz 的文件基本语法选项说明应用实例gzip/gunzip 指令：gzip 用于压缩文件， gunzip 用于解压的基本语法gzip 文件 （功能描述：压缩文件，只能将文件压缩为*.gz 文件

文件目录指令详解pwd 指令：查看路径基本语法应用实例ls 指令：显示当前目录所在的文件和目录基本语法常用选项应用实例cd 指令：切换目录基本语法如何理解绝对路径和相对路径常用参数应用实例mkdir 指令：mkdir 指令用于创建目录(make directory)基本语法常用选项应用实例rmdir 指令：rmdir 指令删除空目录基本语法应用实例使用细节touch 指令：touch 指令创建空文件基本语法应用实例cp 指令[重要]：cp 指令拷贝文件到指定目录基本语法常用选项应用实例rm 指令：rm 指令

使用 Linux 提供的帮助指令来了解这个指令的使用方法，主要有man,help指令

指定运行级别关系详解运行级别说明：0 ：关机1 ：单用户【找回丢失密码】2：多用户状态没有网络服务3：多用户状态有网络服务4：系统未使用保留给用户5：图形界面6：系统重启注意：常用运行级别是3和5，要修改默认的运行级别可修改文件 /etc/inittab 的 id:5:initdefault:这一行中的数字5切换到指定运行级别的指令基本语法init [012356]应用案例通过 init 来切换不同的运行级别，比如动 5->3 ， 然后关机init 3init 5

Linux系统的用户管理——添加用户、删除用户、查询用户信息、切换用户、用户组

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在安装Linux系统使用VMware workstation时，出现与Hyper-V不兼容问题，出现VMware Workstation 与 Hyper-V 不兼容。请先从系统中移除 Hyper-V 角色。1、进入控制面板，点击启用或关闭windows功能，卸载Hyper-V,重起电脑2、以管理员身份运行命令提示符 bcdedit /set hypervisorlaunchtype off3、在"网络适配器"和"设备管理器"中卸载Hyper-V相关驱动，并重新启动

详解 Linux操作系统的目录结构1 基本介绍2 目录结构的具体介绍3 Linux 目录总结1 基本介绍linux 的文件系统是采用级层式的树状目录结构，在此结构中的最上层是根目录“/”，然后在此目录下再创建其他的目录。深刻理解 linux 树状文件目录是非常重要的，这里我给大家说明一下。记住一句经典的话：在 Linux 世界里，一切皆文件。2 目录结构的具体介绍/bin [重点] (/usr/bin、/usr/local/bin)。是Binary的

Linux系统CentOS的安装步骤1 CentOS 安装的步骤1 检查BIOS虚拟化支持2 新建虚拟机3 新建虚拟机向导4 创建虚拟空白光盘5 安装Linux系统对应的CentOS版6 虚拟机命名和定位磁盘位置7 处理器配置，看自己是否是双核、多核8 设置内存为2GB9 网络设置NAT（说明及其示意图的演示）10 选择IO控制器类型11 选择磁盘类型12 新建虚拟磁盘13 设置磁盘容量14 你在哪里存储这个磁盘文件