编译caffe /usr/bin/ld:cannot find -lhdf5 and -lhdf5_hl

方法1：首先确认安装hdf5包，安装使用sudo apt-get install libhdf5-dev

安装完成后重新编译，若仍然出现此错误，在/usr/lib中查找libhdf5.so软连接所在位置，一般在x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/下，将此路径添加在Makefile.config相应位置处：

# 找到这行： LIB_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/lib /usr/lib 

# 替换为： LIB_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/lib /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/

另外查看include头文件是否加载hdf5，如下。

# 找到这行： INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include

# 替换为： INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include /usr/include/hdf5/serial/

 

方法2：不用更改LIB_DIRS，在/usr/lib下简历libhdf5软连接。

sudo ln -sf /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/libhdf5.so /usr/lib/libhdf5.so

sudo ln -sf /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/libhdf5.so.x /usr/lib/libhdf5.so.x，x表示数字，需要你自己查看。

 

方法3：（此方法不是只是解决了编译不报错，但你后续使用到hdf5时可能还会有问题，因为INCLUDE和LIB加载的都不是同一个东西）

需要sudo apt-get install libhdf5-serial-dev

修改Makefile 文件（注意不是）Makefile.config 
将里面的
LIBRARIES += glog gflags protobuf boost_system boost_filesystem m hdf5_hl hdf5

改为LIBRARIES += glog gflags protobuf boost_system boost_filesystem m hdf5_serial_hl hdf5_serial