Python CT pyradiomics

已于 2024-09-03 21:20:39 修改
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于 2024-08-10 23:50:06 首次发布
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获取的CT图像和勾画的轮廓数据均为dicom格式。轮廓数据RTstructure具体数据保存在dicom头文件中。

  1. matlab将勾画的轮廓RTstructure提取成dicom图像。
    代码保存过程中Mask1为Logical。
    如果直接将Mask1保存为dicom格式的时候，matlab会提醒：
    Logical data will be scaled to fit the range [0, 255]. 此时Mask1白色为255，黑色为0.

如果想要保存为0，1格式的：
Mask1 = int16（double（Mask1)）.
因为matlab中给dicomwrite的数据必须是uint16。

  1. radiomics feature shape3D: 有俩相似的特征：Least Axis Length 和 Minor Axis Length
    英文解释很相近，猜测第一个是封闭球体的最短轴长，第二个是封闭球体的短轴长度
小蛋糕爱好者
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使用Pyradiomics提取图像影像组学特征
dr_yingli的博客
07-04 6641
使用Pyradiomics（Python）提取图像（.nrrd）影像组学特征 一、首先要安装Python和Pyradiomics 需要注意的的是Pyradiomics需要C++支持，Microsoft C++ 生成工具可以解决 直接安装pyradiomics，pip会自动安装其他pyradiomics所需的安装包 pip install pyradiomics 二、数据格式及数据储存格式 数据格式：图像使用的是.nrrd格式储存，每个受试者两个文件，一个是图像，一个是体素感兴趣区（VOI） 数据储存格式：
python医疗影像_基于PyRadiomics的医疗影像纹理获取原型系统集成
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12-17 793
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06-07 401
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使用pyradiomics提取影像组学特征【详细】
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weixin_46428351的博客
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使用pyradiomics提取影像组学特征 最近由于项目需求要使用pyradiomics提取影像组学特征，网上阅读了很多别人的博客，学到一些，然后去查看了pyradiomics的官方文档，最后自己实现了特征的提取，写下此文记录，方便日后查看。 首先放上官方文档：https://pyradiomics.readthedocs.io/ 和pyradiomics源代码地址：https://github.com/AIM-Harvard/pyradiomics 第一步、安装 在已经安装好的Python环境下，执行：
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dafeng_xiaobai的博客
06-03 1962
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qq_40515250的博客
03-15 9835
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基于pyradiomics影像组学特征提取
Alexa_的博客
01-14 3840
在这里，我们使用pyradiomics来提取影像组学特征。首先，我们先介绍pyradiomica工具包，然后我们进行特征的提取。PyRadiomics的官方文档:https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/ 1.1.2,设置特征提取器，获得想要特征： 通过自定义特征提取器，可以根据自己的需求来设置并提取特征。 其实，需要设置两个方面：1，图像类型；2，所要提取的特征；3，提取器设置第一步：图像类型：首先，设置提取特征的图像类型，可以指定用于提取特征的图像类型。
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PyPI 官网下载 | pyradiomics-2.2.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl
02-05
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