将二维矩阵中的编号作为三维矩阵中的索引

将二维矩阵中的编号作为三维矩阵中的索引，从而将两个矩阵联系起来。具体实现可以按照以下步骤：

1. 遍历二维矩阵中的每个元素，将其作为索引在三维矩阵中找到对应的活性表达值。

2. 将二维矩阵中的得分值与三维矩阵中的活性表达值进行计算，得到两个蛋白质之间的综合得分。

3. 将计算得到的综合得分保存到一个新的矩阵中，该矩阵的行和列分别对应于二维矩阵中的两个蛋白质编号。

具体实现代码如下：

```python
import numpy as np

# 生成三维矩阵，大小为3x4x5
protein_matrix = np.random.rand(3, 4, 5)

# 生成二维矩阵，大小为6x6
score_matrix = np.random.rand(6, 6)

# 将二维矩阵中的编号作为索引在三维矩阵中找到对应的活性表达值，并计算综合得分
result_matrix = np.zeros((6, 6))
for i in range(6):
    for j in range(6):
        protein1 = i // 4
        protein2 = j // 4
        position1 = i % 4
        position2 = j % 4
        time = (i + j) % 5
        activity1 = protein_matrix[protein1, position1, time]
        activity2 = protein_matrix[protein2, position2, time]
        score =