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原创 使用jade6.5进行标准物相检索提示“run-time error 6 overflow”
把正在运行的jade软件窗口缩小即可(虎扑上看到的解决方法)。
2023-12-25 16:31:14
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原创 相关性热图绘制教程(origin绘制,无须R语言)
相关性热图绘制教程(origin绘制!无需R语言)相关性热图在很多文章中都有出现,一般都是使用R语言进行绘制。在origin中也可以进行同样的绘制,详细过程如下:实例解读这个数据是来源于R中的一个汽车相关的数据库,例如有关hp(马力)和disp(距离)这类性质。在该图第一行第一列的蓝色方框表示汽车的“mpg”属性和“mpg属性”之间的相关性为1,用蓝色和最大的方框表示。第一行第二列的的红色方框表示汽车“cyl”属性和“mpg”属性之间的相关性为~0.7,用浅红色和稍微小一点的方框表示。以此类推,表示
2022-04-23 09:13:11
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原创 R语言之长宽数据转换
R语言之长宽数据转换之前计算物种和抗性基因之间的相关性的时候得了一些宽数据,如下,这里想把它转换为长数据。这里使用两种方法:Tidyr包中的gather函数data <- read.csv("R.csv")#这里直接读入数据第一列的数据直接也包含在了数据中,方便后续直接选定不进行聚合,结构如下图1R_long <- gather(R,key = "species",value = "value",-'x')#这里默认聚合的是所有的列名,聚合后命名为species,其他所有的数值被聚合
2021-11-30 22:59:57
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原创 Materials Studio软件启动问题:Failed to initialise from settings. xml cleanly
Materials Studio软件启动问题:Failed to initialise from settings. xml cleanlyMS安装后出现的问题有很多种,直接上一个最难解决的:由于用户名为中文所导致的(不是安装路径存在中文)。出现这个问题的原因是在一开始安装系统的时候用户名设置为了中文,如下(win+R→输入cmd→按回车键):我这里是修改过了所以是英文的,之前是中文的,所以个人pc电脑在使用过程能用英文命名就用英文命名。修改中文用户名网上有些教程说可以新建一个用户然后每次运行
2021-11-30 12:31:59
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原创 如何查看笔记本最高支持多大的内存
64位系统按win+R调出运行窗口输入cmd输入 wmic memphysical get maxcapacity 按回车运行计算v16777216/1024/1024=16G所以,最高支持内存16G
2021-11-04 22:05:54
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原创 Excel中IFs函数如何输出不满足条件下的内容
IFS函数简介为了简化连续嵌套IF函数的复杂性,使用IFS函数有着较好的效果。用法IFS(逻辑条件, “若满足前面的条件则返回值1,若不满足,看下一个条件”,逻辑条件2,“若满足逻辑条件2则返回值2,若不满足,看下一个条件”,…)比如一个百度上一个例子:将年龄分为四个水平:18以下,19-30,31-50,51以上,那么可以这样子写:=IFS(A2<=18,“18以下”,AND(A2>18,A2<=30),“19-30岁”,AND(A2>30,A2<=50),“30-
2021-10-21 09:32:06
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原创 保姆级聚类热图绘制!(不用R语言!不用写代码!)
保姆级聚类热图绘制!(不用R语言!不用写代码!)现阶段主流热图用R进行绘制,然而部分专业例如环境专业的同学们基本不怎么会使用代码去得到自己想要的图形(当然也不排除有厉害的同学也是会的)。环境专业的老哥们用的最熟练的莫过于origin了,origin自带的绘图中也是有热图的模块的,但是并不能进行聚类热图的绘制,本篇博客主要内容为使用originpro绘制一张SCI论文插图级别的热图。数据:数据的解释大家看看图就可以明白,(●’◡’●)。步骤:启动originpro,导入数据对数据进行归一化在
2021-10-13 10:31:32
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原创 rstudio绘制的图形导出pdf不显示文字内容,导出png正常显示
问题:之前绘制一个热图的时候,发现导出pdf的时候居然不显示文字!但是导出png的时候又是是正常显示的。我就纳闷了,如图所示:csdn自带的编辑器不太会调整,各位见谅将就着看哈。原因:(手动狗头)我发现我代码里面设置了字体,然鹅我系统里面没有这种字体。pheatmap(fontfamily="Arial",fontsize = 6,fontface="italic")### 这个不是完整的代码,是出问题的原因Warning messages:1: In grid.Call(C_text
2021-10-10 20:58:36
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原创 R语言之相关系数计算篇
R语言之相关系数计算篇简介:在环境微生物类的文章中,经常出现计算物种与基因、基因与基因、基因与代谢物之间的相关系数的内容,在这个计算的基础之上再进行相关的可视化。例如相关性热图、网络图等等。文献中常出现的相关系数有Spearman、Pearson两种。案例:之间课题组一个师姐想代谢组学中代谢物与基因之间的相关性,共选择了95种代谢物,3313个相关基因,三个实验组一个对照组(每组三个生物学重复,共计12个样本)如下:[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-vw
2021-08-23 21:42:40
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原创 R语言绘制气泡矩阵图
R语言绘制气泡矩阵图示例图之前在一些文章中看到过气泡矩阵的表达方法,该图形表达的意思就是不同样本中不同物种的丰度分布情况,气泡越大则是代表物种的相对丰度(或者说16S得到的绝对丰度)越大,在这个例图中则是表达了四个样本中三类不同的菌的分布情况。实操整个过程都是通过R代码复现,因为没有原数据所以这里使用的是示例数据,后期得到的图形还需要经过AI修改这里就不详细阐述了,水平有限勿喷。示例数据格式:代码:setwd("C:/Users/机械师/desktop")#设置工作路径data<-
2021-06-24 19:33:22
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转载 16S rDNA测序和宏基因组测序区别
16S测序和宏基因组测序区别测序原理不同16SrDNA基因存在于所有细菌的基因组中,具有高度的保守性。该序列包含9个高变区和10个保守区,通过对某一段高变区序列(V4区或V3-V4区)进行PCR扩增后进行测序,得到1500bp左右的序列。宏基因测序测试将微生物基因组DNA随机打断成500bp的小片段,然后再片的两端加入通用引物进行PCR扩增测序,再通过组装的方式,将小片段拼接成较长的序列。研究目的不同16S测序主要研究群落的物种组成、物种间的进化关系以及群落的多样性。宏基因组测序在16S测序的基础上
2021-06-17 16:41:36
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原创 Origin拟合Gompertz模型描述产甲烷过程
简介:之前一个学妹做厌氧产氢的实验时突然问到了拟合Gompertz方程的问题,闲着没事弄了弄,过程还略微有点糟心,然后就写成了贴子,仅供大家参考咯(如果你觉得我写错了那就是你对了,勿喷(●ˇ∀ˇ●))。Gompertz模型最早是被 Jiunn- Jyi Lay用于描述产甲烷过程的累积产气量,也可以用来对产氢动力学进行分析。1 方程首先,咱得知道这个方程长啥样,才能写出来这个方程。进而使用软件去进行拟合。1.1 错误方程示例这是一篇十年前的哈工大的一篇博士论文,个人感觉这里的“A”和“H”表述错误
2021-05-14 18:55:37
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原创 修改PC端微信提示音
大清早跑到办公室上班,此起彼伏的同一微信提示音可闹的头大。以为来邮件了,????中了,然鹅我连微信都没登录。所需材料exescope软件、提示音文件(.wav)、还有你可可爱爱的脑袋????步骤(首先退出微信!首先退出微信!首先退出微信!)1、下载软件,然后挑选自己喜欢的提示音。exescope软件:链接:https://pan.baidu.com/s/1hyBk6AbaX7U1jZwvpjVVMQ提取码:vbxe提示音(自己选叭):https://www.ear0.com/2、安装软
2021-04-01 11:05:10
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原创 R语言单因素方差分析(附代码)
单因素方差分析概念不给大家赘述了,可自行查阅相关书籍。直接上题目:题目pseudomonas aeruginosa菌在样本A中的丰度为:0.014,0.015,0.017;在样本B中的丰度为:0.011,0.012,0.013。确定该菌株在样本A、B中的分布是否具有差异性。简单分析该问题为单因素方差分析,这里的因素就是指样本,简而言之就是单个因素的两种情况。我们不妨设定一个假设:H0(原假设):该菌株在样本中的分布差异不显著,H0(备选假设):该菌株在样本中的分布差异显著。这样设置的原因是根据假
2021-03-24 10:27:45
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原创 Gephi图形导出PDF不显示节点
gephi图形导出PDF不显示节点最近使用gephi导出网络图发现导出格式为矢量图PDF、SVG时不显示节点,但是导出PNG时显示节点。最后结合自己的操作以及整合其他人的经验发现了原因所在。不出现节点的原因原因是在预览界面的管理渲染器选项卡中缺省节点选项卡不见了。删除自己安装的一些插件例如我之前为了表述不同形状节点使用了Polygon Shaped Nodes插件,卸载这个插件之后就发现管理渲染器中的缺省节点出现啦!结语gephi经常出毛病,建议各位还是转cytoscape叭。但是有个疑问就
2021-03-18 22:37:23
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原创 R语言中ggplot Theme Assist安装使用教程
gg theme assist安装由于ggplot2主题设置的内部函数及参数非常多,所以很难入门,所以有了gg theme assist的出现。安装的代码如下(注意需要先安装shiny包之后才可以安装ggthemeassist):install.packages("shiny")install.packages("ggthemeassist")library(shiny)library(ggThemeAssist)安装通常会出现的问题shiny包版本过低错误: package or na
2021-03-09 19:47:42
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原创 共轭梯度法求解线性方程组Ax=b(附代码)
共梯度法求解线性方程组:Ax=b数值分析老师给的作业,写出来代码平时分满分。简单勿喷,hhhh原理CG求解线性方程组的原理大家翻一翻数值分析的课本即可,此处不哔哔直接上matlab代码代码%qjyangclcclear;A = [10 1 2 3 4 4 9 -3 1 -3 2 -1 7 3 -5 3 2 3 12 -2 4 -3 -5 -1 15];%求解线性方程组Ax=bb=[12 -27 14 17 12]';x0=ones(5,1);%给定的初始点
2020-12-30 16:47:48
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原创 Matlab使用lsqcurvefit函数拟合已知函数方程组求解常数项(求解金属离子多组分竞争吸附中的吸附常数)
拟合多变量已知函数求解参数值欢迎使用Markdown编辑器新的改变功能快捷键合理的创建标题,有助于目录的生成如何改变文本的样式插入链接与图片如何插入一段漂亮的代码片生成一个适合你的列表创建一个表格设定内容居中、居左、居右SmartyPants创建一个自定义列表如何创建一个注脚注释也是必不可少的KaTeX数学公式新的甘特图功能,丰富你的文章UML 图表FLowchart流程图导出与导入导出导入欢迎使用Markdown编辑器你好! 这是你第一次使用 Markdown编辑器 所展示的欢迎页。如果你想学习如何使
2020-12-05 16:46:27
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原创 R语言风玫瑰图绘制(附代码)
R语言风玫瑰图绘制#载入ggplot2包library(ggplot2)#随机生成100此风向,并汇集到16个区间内dir<-cut_interval(runif(100,0,360),n=16)#随机生成100次风速,并划分为4种强度mag<-cut_interval(rgamma(100,15),4)#把dir数据和mag数据整合为数据框sample<-data.frame(dir=dir,mag=mag)#绘图ggplot(sample,aes(x=dir,y=.
2020-11-18 21:07:47
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2022年6月28日JCR官网公布2022年完整版影响因子
2022-06-28
originpro主成分分析app
2022-06-03
本硕博毕业论文中所使用的参靠文献格式Chinese Std GBT7714(在原有基础上修改)
2022-04-03
华为杯研赛历年赛题(截止2021年).zip
2020-12-05
空空如也
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