HPC Challenge 1.5.0 安装教程

操作系统

• Ubuntu 18.04
• hpcc 1.5.0
• mpich 3.1

安装过程

A. hpcc1.5.0源码下载

• 下载hpcc-1.5.0.tar.gz文件

  wget http://icl.cs.utk.edu/projectsfiles/hpcc/download/hpcc-1.5.0.tar.gz

• 解压文件，会产生hpcc-1.5.0文件夹

  tar zxvf hpcc-1.5.0.tar.gz

• 进入hpcc-1.5.0文件夹

  cd hpcc-1.5.0

• 在该目录下创建lib文件夹，存放后续产生的libcblas.a和libblas.a

  mkdir lib

  记住该路径xxx/hpcc-1.5.0/lib，后面会用。

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B. mpich安装

• 安装 make，gcc，g++，gfortran

  sudo apt-get install make
  sudo apt-get install gcc
  sudo apt-get install g++
  sudo apt-get install gfortran
  

• 下载mpich安装包mpich-3.1.tar.gz，下载地址www.mpich.org/downloads/

• 目标：将mpich安装到/usr/mpich文件夹

  • 创建安装文件夹

    sudo mkdir /usr/mpich

  • 将mpich-3.1.tar.gz安装包复制到/usr/mpich文件夹

    sudo cp xxx/mpich-3.1.tar.gz /usr/mpich

    这里，xxx是当前存放mpich-3.1.tar.gz文件的位置，注意替换。

  • 解压安装包

    sudo tar zxvf mpich-3.1.tar.gz

  • 进入解压文件夹

    cd mpich-3.1

  • 执行命令

    sudo ./configure --prefix=/usr/mpich

    若显示Configure completed表示注册成功。

  • 在当前文件夹目录下编译

    sudo make

  • 安装

    sudo make install

  • 配置环境变量

    sudo gedit /etc/profile
    # 在打开的文件最后添加下述命令
    export PATH=/usr/mpich/bin:$PATH
    export INCLUDE=/usr/mpich/include:$INCLUDE
    export LD_LIBRARY_PATH=/usr/mpich/lib:$LD_LIBRARY_PATH
    

  • 使配置文件生效

    source /etc/profile

  • 测试是否安装成功

    which mpicc

    若输出/usr/mpicc/bin/mpicc则安装成功。

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C. BLAS库文件安装

• 下载BLAS

  wget http://www.netlib.org/blas/blas.tgz

• 解压BLAS

  tar zxvf blas.tgz

• 进入BLAS

  cd BLAS

• 编译所有的 .f 文件，生成 .o文件

  gfortran -c -O3 *.f

• 链接所有的 .o文件，生成 libblas.a 文件

  ar rv libblas.a *.o

• 将libblas.a文件拷到前面记住的xxx/hpcc-1.5.0/lib/目录下

  cp libblas.a xxx/hpcc-1.5.0/lib/

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D. CBLAS库文件安装

• 下载CBLAS

  wget http://www.netlib.org/blas/blast-forum/cblas.tgz

• 解压CBLAS

  tar zxvf cblas.tgz

• 进入CBLAS

  cd CBLAS

• 将Makefile.LINUX文件拷贝为Makefile.in文件

  cp Makefile.LINUX Makefile.in

• 将BLAS库文件安装过程中产生的libblas.a文件拷贝至./testing文件夹下

  cp xxx/hpcc-1.5.0/lib/libblas.a ./testing/

• 编译，在lib文件夹下产生cblas_LINUX.a

  make

• 将lib文件夹下的cblas_LINUX.a拷贝至前面记住的xxx/hpcc-1.5.0/lib/目录下，并重命名为libcblas.a

  cp lib/cblas_LINUX.a xxx/hpcc-1.5.0/lib/libcblas.a

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E. Makefile文件编写

• 进入hpcc-1.5.0文件夹，该目录下有一个文件夹为hpl

• 复制hpl/setup/Make.Linux_PII_CBLAS文件到hpl/目录下，并重命名为Make.LINUX

  cp hpl/setup/Make.Linux_PII_CBLAS hpl/Make.LINUX

• 修改Make.LINUX文件

  gedit hpl/Make.LINUX

  • MPdir、MPinc、MPlib这几个和MPI相关的配置项注释掉

    # MPdir        = /usr/local/mpi
    # MPinc        = -I$(MPdir)/include
    # MPlib        = $(MPdir)/lib/libmpich.a
    

  • HPL_LIBS后面加上BLAS、CBLAS库的连接信息，这里要用xxx/hpcc-1.5.0/lib这一路径，同时将$(LAlib)这一参数去掉

    HPL_LIBS     = $(HPLlib) $(MPlib) 
    -lm -L/home/masa/Desktop/ArchitectureSoft/hpcc-1.5.0/lib/ 
    -lcblas -lblas
    

    这里我把hpcc的源码放在/home/masa/Desktop/ArchitectureSoft/hpcc-1.5.0

    这一路径下。

  • CC配置项修改为mpicc:

    CC = /usr/bin/mpicc

    建议这里查找下mpicc路径：

    which mpicc

  • LINKER配置项修改为mpif77

    LINKER = /usr/bin/mpif77

    同样建议这里查找下mpif77路径：

    which mpif77

• 修改hpcc-1.5.0/路径下的Makefile文件，其第3行改为：

  arch = LINUX

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F. 编译并运行hpcc源码

• 进入hpcc-1.5.0/路径下编译

  make

  此时hpcc-1.5.0/路径下会产生一个名为hpcc的二进制可执行文件。

• 将hpcc-1.5.0/路径下的_hpccinf.txt重命名为hpccinf.txt

  cp _hpccinf.txt hpccinf.txt

• 运行hpcc

  mpirun -np 4 ./hpcc

  运行结束后结果写入hpccoutf.txt。查看结果：

  cat hpccoutf.txt

• 重置编译

  make clean

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