LDpred下载过程中的重重bug

首先在下载plinkio的过程中遇到了问题

在查阅各种资料之后发现要下载wheel文件，在PyPI plinkio · PyPI中找到了，之后将文件名改成plinkio-0.9.8-cp312-cp312-win_amd64.whl后运行

pip install  plinkio-0.9.8-cp312-cp312-win_amd64.whl

没有报错了。

但是 下一步又报错了！

pip install ldpred
ldpred coord --help

仔细检查scipy的文件中确实没有isfinite函数，又查资料发现可以将sum_stats_parsers.py文件中的from scipy import isfinite 改成

from numpy import isfinite

但是下一步又出现了新的问题

查看Plinkio的文件夹里，关于cplinkio的文件只有一个cplinkio.cpython-38-darwin.os文件，而这是一个针对 Darwin（macOS） 系统编译的 .so 文件，而不是 Windows 系统下所需的 .pyd 文件。到处都找不到.pyd文件呀！我看到github上有一个cplinkio文件libplinkio/py-plinkio/src at master · mfranberg/libplinkio · GitHub，把这个文件下载到plinkio文件夹里再次运行，啊啊啊啊终于成功了！！！

一个小小安装包，花了我两三天的时间，真是崩溃！不过还好最后发现了怎么办！！！供大家参考！

注意：ldpred文件夹中sum_stats_parsers.py还有一些错误包括，

from scipy import isfinite 

要改成

import numpy as np
from numpy import isfinite 

下面有一句也要改

return np.sign(raw_beta) * abs_beta/ np.sqrt(N)