BrainNet Viewer教程——大脑可视化

用BrainNet Viewer自带的data画图

先在MATLAB中输入BrainNet Viewer-> Load Files

功能连接只需要加载前面三项不需要加上第四项。
Surface File文件夹，这个一般是BrainNet中给定的模版，点击Browse…选择模版BrainMesh_ICBM152.nv（本次选择此模版）。
Data file（node）节点数据文件，选择BrainNet Viewer安装包中的ExampleFile文件中的ALL90文件中的节点文件。
Data file（edge）边的数据文件，选择BrainNet Viewer安装包中的ExampleFile文件中的ALL90文件中的连边文件。
然后点OK会出现接下来的BrainNet_Option的选项卡，在此选项卡中，可以自己调节Layout、Global、Surface、node、edge、Volume、image等，一般画功能连接图时不需要调节Volume（画皮层图）。

根据自己的数据画功能连接图

画节点图
Surface file和上面的一样也是使用模版BrainMesh_ICBM152.nv；
Data file（node）根据自己的结果生成自己的node文件，
在MATLAB中载入load('D:\my\data3\Results\ROISignals_FunImg\ROICorrelation_Sub_001.mat')，然后会出现一个变量ROICorrelation将此变量改为R，方便后续进行操作，然后在命令行输入：

R=R(1:90,1:90); %AAL模板总共有116个脑区，前90个是大脑
for i=1:90
R(i,i)=0；%对称矩阵设置为0
end
A=find(R>0.85);%矩阵稀疏化，取大于0.85的为1，否则为0
R1=zeros(90,90);
R1(A)=1;
Imagesc(R1) %画出相关矩阵R的图，画功能连接图
node=sum(R) %算节点的度，即在画边的图中选那些点是有边的
node=node’; %将得到的node矩阵进行转置，进行转置后就是我们所需要的。

先在其他位置复制粘贴一份Node_ALL90.node文件，打开此文件，可以用写字板、wps打开，可以看到其中有很多列，第四列为node列为我们要修改的列，将其复制粘贴到一个Excel文件中将所得的node进行复制，替换Excel中对应的第四列，将修改以后的文字进行一个只粘贴文本的操作，达到修改第四列的目的，将修改好的.node文件保存，这个就是我们所需要的.node文件，我们可以将此文件放入那个Data file（node）中。

画边图
Data file（edge）先在其他位置复制粘贴一份Edge_ALL90_Binary.edge文件，打开此文件，用Excel打开，用上面得到的R1文件替换此文件中的表格，就可以得到我们所需要的 .edge文件。复制稀疏化后的矩阵替换aal.test.edge文件。

载入surface文件ICBM-152.nv，载入上一步得到的node，edge文件就可以了，注意node，edge的边要修改相对应。