CDO (Climate Data Operator) 安装方法总结（最全）

前言

之前CDO安装一直踩了很多坑，在linux系统上采用：

sudo apt install

安装之后显示包依赖不全，可知CDO处理netcdf4, hdf等文件还需要自行配置环境（compile），编译（make）和安装（make install），经过了两天的折磨之后，终于成功在ubuntu子系统上安装了CDO，先将方法总结如下：

方法总结

需要的软件包

已给出百度云链接（主要需要的包有：NetCDF, Grib API, zlib, HDF5, CDO, Jasper, libcurl）

步骤

以下步骤务必按照顺序安装

1. 在opt根目录创建一个文件夹，请将之前下载的所有包全部复制到该文件夹中，该文件夹也将存放之后下载过程中产生的include和libs文件。为了演示方便，我们使用/opt/cdo-install
   

2. 安装zlib：1）进入zlib的文件夹；2）./configure --prefix=/opt/cdo-install；3) make; 4) make install;

3. 安装hdf5：1)进入hdf5文件夹；2）./configure –with-zlib=/opt/cdo-install –prefix=/opt/cdo-install CFLAGS=-fPIC；3）make；4) make install;

4. 安装libcurl：1）进入libcurl文件夹；2）./configure --prefix=/opt/cdo-install；3）make；4）make install；

5. 安装NetCDF：1）进入NetCDF文件夹；2）CPPFLAGS=-I/opt/cdo-install/include LDFLAGS=-L/opt/cdo-install/lib ./configure –prefix=/opt/cdo-install CFLAGS=-fPIC；3）make；4）make install；

6. 安装Jasper：1）进入Jasper文件夹；2）./configure –prefix=/opt/cdo-install CFLAGS=-fPIC；3）make；4）make isntall；

7. 安装grib：1）进入grib-API文件夹；2）./configure –prefix=/opt/cdo-install CFLAGS=-fPIC –with-netcdf=/opt/cdo-install –with-jasper=/opt/cdo-install；3）make；4）make install；

8. 安装cdo：1）进入cdo文件夹；2）./configure –prefix=/opt/cdo-install CFLAGS=-fPIC –with-netcdf=/opt/cdo-install –with-jasper=/opt/cdo-install –with-hdf5=/opt/cdo-install –with-grib_api=/opt/cdo-install；3）make；4）make install;

问题与解决方案

• 碰到 permission denied：
  • 方案一：su root，申请root权限，输入密码；
  • 方案二：chmod 777 FILE（FILE改成permission denied的文件名），升级aceess该文件名的权限；
  • 方案三：如果是./configure配置过程出现permission denied，那么请输入bash ./configure，而不是./configure；
  • 遇到报错API_version=v18，重新下载编译该报错的包，注意在编译过程中加上末尾的default-api-version=v18

`LDFLAGS=-L/usr/local/lib CPPFLAGS=-I/usr/local/include ./configure --enable-netcdf-4 --enable-dap --enable-shared --prefix=/usr/local --with-curl=/usr/local --with-default-api-version=v18`