![](https://img-blog.csdnimg.cn/20201014180756926.png?x-oss-process=image/resize,m_fixed,h_64,w_64)
虚拟机
文章平均质量分 72
年糕瓤
这个作者很懒,什么都没留下…
展开
-
安装multiqc和seqkit
pip install git+https://github.com/ewels/MultiQC.git #Installation with pi #命令行输入。export PATH=/root/anaconda3/bin/multiqc:$PATH #输入环境变量,ctrl+x。source ~/.bashrc #在命令行输入,意思为保存文件,手动生效。multiqc . #注意点之前有空格。#设置环境变量的方式。原创 2022-10-14 21:22:57 · 543 阅读 · 0 评论 -
安装与使用bwa和samtools的步骤
export PATH=/home/zach/samtools/to/install/bin:$PATH >> ~/.bashrc #设置samtools的环境变量。./configure --prefix=/where/to/install #等号后面更改为你想要安装samtools的路径。得到bwa-master.zip,然后进入保存该文件的目录,用命令unzip bwa-master.zip对其解压。cd ./samtools #进入目录./samtools。...原创 2022-08-25 22:20:24 · 5429 阅读 · 1 评论 -
学习如何利用docker建立容器,然后用fastqc分析数据
(base) [root@localhost zach]# conda install multiqc #下载一个multiqc可以批量多线程处理数据。(base) [root@localhost zach]# docker rename 47cdc1d24521 rna_docker #给容器重命名。fastqc *gz -o result #用fastqc处理gz结尾的数据。docker ps -a #查看已创建的容器。docker ps #查看运行中的容器。...原创 2022-08-21 11:37:36 · 462 阅读 · 0 评论