安装multiqc和seqkit

pip install git+https://github.com/ewels/MultiQC.git #Installation with pi   #命令行输入

which multiqc   #查找multiqc安装位置，得到：

/root/anaconda3/bin/multiqc

vim ~/.bashrc    #设置环境变量的方式

export PATH=/root/anaconda3/bin/multiqc:$PATH   #输入环境变量，ctrl+x

source ~/.bashrc     #在命令行输入，意思为保存文件，手动生效

在数据的当前目录，可以直接输入：

multiqc .  #注意点之前有空格

查看fq.gz前8行的序列：

zcat SUC1_2_2.fq.gz | head -n 8

安装seqkit：

git clone https://github.com/shenwei356/seqkit

运行seqkit：

docker build -t seqkit .   #别忘了最后有个点

docker run -it seqkit:latest