3D Slicer Markups模块 标记点使用简易说明

已于 2022-12-29 10:57:36 修改
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分类专栏： 医学图像处理 文章标签： 图像处理 3D Slicer
于 2022-12-29 10:14:53 首次发布
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  • 建新的mark的时候，要先点击1，再点击2
  • 但是点击1会生成新的Node，所以需要再删掉不需要的Node，不知道有没有更合理的操作，感觉这样有点傻。。。(后来找到了，再上面一排的任务栏有个小箭头，create and place)

添加新的mark 

 

Slicer学习笔记（四十三）slicer Markups操作
juluwangriyue的博客
01-21 792
Slicer学习笔记（四十三）slicer Markups操作 参考：Script repository 参考：Markups 参考：
Slicer学习笔记（三十一）slicer调试Markups模块
juluwangriyue的博客
12-08 1019
Slicer学习笔记（三十一）slicer调试Markups模块1、源码编译3d slicer2、调试Markup模块2.1、调试设置2.2、进入调试2.3、通过上述一顿操作，我可以学到什么2.3.1、Q_D 与 Q_Q2.3.2、创建新基准点 fiducial 1、源码编译3d slicer 自己根据官网说明编译。 2、调试Markup模块 2.1、调试设置 编译时选择编译模式为RelWithDeb。 编译成功后就可以调试自己想学习的模块了。 此时我想学习的是Markups模块，所以就调试这个模块了。 先
3Dslicer_MarkupsModule
Huadong_eddy的博客
05-12 2659
一、模块简介 该模块是用来管理slicer中的标签（markups）的，基于Slicer 3.6中Fiducials module的功能，其中的元素从Slicer 4.2的Annotations module转移而来。目前该模块中仅支持基准点（fiducials）元素的使用。 模块的功能主要是创建、编辑场景中的标签以及一些附带信息，当前支持的标签是基准点列表（lists of fiducial...
在Slicer中添加点、直线和曲线
huihui__huihui的博客
08-30 585
无摘要
在3D Slicer中使用 Monai Bundle 和 Model Zoo 标注医学影像数据-CT肺结节检测
Tina姐的博客
08-30 2007
MONAIModel Zoo提供了一系列由社区开发的医学影像模型，采用格式。Monai Bundle 允许您轻松获取任何来自 MONAI Model Zoo 的模型并将其导入 MONAILabel。Model Zoo提供的模型包括MRI脑肿瘤分割，CT肺结节检测，病理细胞核分割分类，CT胰腺分割，MRI前列腺分割，CT肾脏分割，CT脾脏分割，MRI脑切片生成等20几个模型。后面会用单独的篇幅分别介绍这些预训练模型的使用。
**3DSlicer**之Python脚本储存库翻译_10.Markups(1)
伪民科小白随意折腾随心记
05-04 754
Drop two markup points on a slice view and copy-paste the code below into the Python console. After this, as you move the markups you’ll see a circle following the markups. 译：在Slicer视图上放置两个标记点，然后将以下代码复制粘贴到Python控制台中。此后，当您移动标记时，标记后面会出现一个圆圈。...
Slicer学习笔记（三十九）slicer中Markups模块
juluwangriyue的博客
01-14 702
Slicer学习笔记（三十九）slicer中Markups模块1、概念1.1、Markups模块简介1.2、应用方向1.3、界面面板1.Markups List2.Buttons And Checkboxes3.Markups Table4.Advanced: Buttons、Naming、Conversion5.Advanced: Display Properties6.Advanced: Display Properties: Fiducuial Projection2、python开发3、C++开发
【3D Slicer】的小白入门使用指南一
图挖掘领域，新晋砖家 ☞ 未来可期，欢迎和静静一起学习交流吖
11-11 3060
3D Slicer 是一个免费的开源软件平台，用于医学、生物医学和其他 3D 图像的可视化、处理、分割、配准和分析。Slicer 的功能包括：读/写。
【3D Slicer】的小白入门使用指南五
图挖掘领域，新晋砖家 ☞ 未来可期，欢迎和静静一起学习交流吖
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本教程演示了在Slicer的新分割编辑器模块中进行分割，以3D打印为目的。国家医学影像计算联盟作用举例：创建的脊柱模型的临床应用学习资料分割编辑器模块。
【3D Slicer】的小白入门使用指南六
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11-13 453
对于着色不对的位置，进行重新调整：点击菜单栏处的黄色十字架+选中左侧的segmentation+选中需要绘制模块的颜色（蓝色）+点击paint，在右侧3D区域操作得到（需要注意的是，操作的区域左下角最底部会显示该segment部分是啥）选中不同的color对应的心脏位置区域后，点击paint就对心脏不同位置，填充不同的颜色框在相应的位置进行着色（这个过程中可以通过移动滑块来帮助自己找到对应的区域）右侧移动滑块+移动边框，移动位置找到自己关注的区域即可，然后点击apply(其他参数也要设置的和图片一致）
使用3D Slicer进行图像配准
qq_46126537的博客
07-05 2839
接下来我们需要实用配准变化矩阵将刚才标记的点配准到配准结果图上，首先将点复制一份，再切换到transforms模式，并选好配准变化矩阵。接下来进行配准操作，我们需要得到配准后的结果以及配准过程中的变换矩阵，先切换到配准模式，实用刚才安装的配准插件进行配准。安装完成后重新打开软件，进行图像配准操作，首先需要打开MNI标准数据和待配准数据，切换到data模式可以查看数据。配准结束后回到data模式，可以看到生成的配准结果以及配准变化矩阵。然后选择刚才复制的点，先变换，后保存变换结果。
3D Slicer导入标签与查看标签
qq_15054345的博客
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《Fully automated quantitative cephalometry using convolutional neural networks》解读 定量头颅测量在临床诊断、治疗和手术中起着至关重要的作用。对于这些程序的完全自动化技术的开发对于实现持续准确的计算机化分析是重要的。这篇论文研究了深度卷积网络（CNN）在全自动定量头颅测量中的应用。 论文所提出的框架利
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机器视觉中所用的标志点一般为圆形，圆形标志点会因拍摄角度的问题而在图像中呈现椭圆形，因此标志点检测一般是指椭圆检测，目的是获得标志点圆心坐标。OpenCV实现如下，编程环境为Qt5.3.2. 需要包含的OpenCV头文件如下： #include #include #include #include 源文件内容： int sliderPos = 60;//图像二值化阈值 int si
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这章属于比较日常的简单描述,主要是防止以后记不住了写的备忘录.3dslicer里面主要功能其实在这里,modules 模块.我们挨着顺一下这些功能.(分割和配准 我们后面从源码学习吧)
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上一章下载3d slicer的软件,这章从加载数据集来弄清楚3dslicer怎么使用.如果没有数据集,也可用用样本数据.可以添加图片文件夹,(试了MP4不行,内镜的视频估计不支持),添加单个图片的话,会出现一些选项,‌ 这种图通常用于医学图像处理中，表示解剖结构、病变和其他对象的空间位置。图像分割是制作标签图的过程，可以通过手动、半自动或全自动的方法进行‌1。在3D Slicer中，标签图可以用于多种用途，包括可视化某些结构、进行定量分析（如测量体积、表面、形状属性）、3D打印和遮罩处理等。
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Slicer markups指的是在医学图像处理软件（如3D Slicer）中用于标记和测量医学图像的工具。这些标记可以用于标记和测量感兴趣的区域，比如肿瘤或器官。它们可以用于提取特定区域的尺寸、距离、角度和体积等信息。 Slicer markups可以通过不同的形状（如点、线、多边形）和颜色来表示不同的标记。使用这些工具，医生或研究者可以在医学图像上进行可视化标注，以便更好地分析和理解图像中的结构和变化。 这些标记可以用于与其他研究人员和医生共享和讨论，促进合作和提高医学诊断和研究的精度和准确性。此外，标记还可以用于跟踪治疗过程中结构的变化，以评估治疗效果。 总而言之，Slicer markups是一种在医学图像处理中用于标记和测量医学图像的工具，它可以帮助医生和研究者更准确地分析和评估医学图像，促进医学研究和临床诊断的进步。
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