Mitk结构介绍以及二次开发

一 层次介绍

MITK（Medical Imaging Interaction Toolkit）的代码结构是经过精心设计的，以支持复杂的医学影像处理和可视化任务。以下是对MITK代码层次的详细分析：

1. 核心层（Core）
   - 数据管理（Data Management）
     * 提供基本的数据结构和管理机制
     * 包括图像、表面、点集等数据类型的处理
   - 算法库（Algorithms）
     * 实现基础的图像处理算法
     * 包括滤波、分割、配准等功能
   - IO模块（Input/Output）
     * 处理各种医学影像格式的读写
     * 支持DICOM、NIfTI等标准格式

2. 可视化层（Visualization）
   - 渲染引擎（Rendering Engine）
     * 基于VTK的3D渲染
     * 2D图像显示和多平面重建（MPR）
   - 交互工具（Interaction Tools）
     * 提供鼠标、键盘交互的接口
     * 实现缩放、平移、旋转等基本操作

3. 应用框架（Application Framework）
   - 插件系统（Plugin System）
     * 支持动态加载和卸载功能模块
     * 提供插件开发的API和工具
   - 用户界面框架（UI Framework）
     * 基于Qt的界面设计
     * 提供常用的UI组件和布局

4. 服务层（Service Layer）
   - 事件系统（Event System）
     * 管理和分发应用内的事件
   - 日志系统（Logging System）
     * 提供调试和错误跟踪功能

5. 模块层（Modules）
   - 图像分割模块（Segmentation）
   - 图像配准模块（Registration）
   - 图像测量模块（Measurement）
   - 每个模块都可以独立开发和维护

6. 工具集（Toolkits）
   - MITK-IGT：用于图像引导手术
   - MITK-DiffusionImaging：用于扩散张量成像

7. 测试框架（Testing Framework）
   - 单元测试（Unit Tests）
   - 集成测试（Integration Tests）
   - 性能测试（Performance Tests）

8. 文档和示例（Documentation and Examples）
   - API文档
   - 教程和使用指南
   - 示例应用和代码

9. 构建系统（Build System）
   - 基于CMake的跨平台构建配置
   - 依赖管理和版本控制

10. 外部依赖（External Dependencies）
    - VTK：用于可视化
    - ITK：用于图像处理
    - Qt：用于GUI开发
    - Boost：提供额外的C++功能

这种分层结构使MITK具有高度的模块化和可扩展性，允许开发者根据需要选择和定制功能。同时，它也为不同层次的开发提供了清晰的界限，便于团队协作和代码维护。
 

二 插件方式二次开发

进行MITK的二次开发涉及多个步骤和最佳实践。以下是一个详细的指南，帮助你开始MITK的二次开发：

1. 环境设置
   - 安装必要的工具：CMake, Git, 合适的C++编译器
   - 下载并编译MITK源代码
   - 熟悉MITK的构建系统和目录结构

2. 了解MITK架构
   - 深入研究MITK的核心概念和模块
   - 熟悉MITK的插件系统和数据模型

3. 创建新项目
   - 使用MITK提供的项目模板创建新的项目
   - 配置CMakeLists.txt文件，确保正确链接MITK库

4. 开发新功能
   - 选择合适的开发方式：
     * 创建新的MITK插件
     * 扩展现有模块
     * 开发独立的应用程序
   - 实现你的自定义功能
   - 利用MITK提供的API和服务

5. 插件开发（常见的二次开发方式）
   - 创建插件骨架：使用MITK提供的向导或模板
   - 实现插件激活器（Activator）类
   - 定义插件的服务和扩展点
   - 实现具体的功能逻辑

6. 用户界面开发
   - 使用Qt Designer设计界面
   - 实现自定义的Qt小部件
   - 将UI与MITK的数据模型和渲染系统集成

7. 数据处理和算法实现
   - 利用ITK和VTK实现图像处理算法
   - 创建自定义的MITK数据类型（如果需要）
   - 实现数据的IO操作

8. 测试和调试
   - 编写单元测试和集成测试
   - 使用MITK的日志系统进行调试
   - 利用MITK提供的测试框架

9. 文档和注释
   - 为你的代码添加详细的注释
   - 编写用户文档和API文档
   - 创建示例和教程

10. 版本控制和协作
    - 使用Git进行版本控制
    - 遵循MITK的编码规范和贡献指南

11. 性能优化
    - 使用性能分析工具识别瓶颈
    - 优化数据处理和渲染性能

12. 跨平台兼容性
    - 确保你的代码在不同操作系统上都能正常工作
    - 使用CMake管理跨平台构建

13. 持续集成/持续部署（CI/CD）
    - 设置自动化构建和测试流程
    - 使用CI工具（如Jenkins, GitLab CI）

14. 更新和维护
    - 跟踪MITK的更新，及时更新你的代码
    - 定期重构和优化你的代码

15. 社区参与
    - 参与MITK社区讨论
    - 考虑将你的贡献回馈给MITK主项目

通过遵循这些步骤，你可以有效地进行MITK的二次开发，创建强大的医学影像应用程序。记住，MITK是一个复杂的框架，可能需要一些时间来完全掌握。耐心学习和实践是成功的关键。
 

三 纯Qt方式 二次开发

使用纯Qt进行MITK的二次开发是一个很好的选择，因为MITK本身就大量使用了Qt框架。以下是使用纯Qt进行MITK二次开发的详细步骤和建议：

1. 环境设置
   - 安装Qt和Qt Creator
   - 安装CMake
   - 下载并编译MITK源代码
   - 确保MITK的库和头文件路径正确设置

2. 创建Qt项目
   - 在Qt Creator中创建新的Qt Widgets Application
   - 配置项目以使用MITK
     * 在.pro文件中添加MITK库路径和包含路径
     * 链接必要的MITK库

3. 配置CMake（如果使用CMake）
   - 创建CMakeLists.txt文件
   - 设置项目名称和Qt组件
   - 添加MITK依赖
   ```cmake
   find_package(MITK REQUIRED)
   include(${MITK_USE_FILE})
   ```

4. 设计用户界面
   - 使用Qt Designer创建主窗口和对话框
   - 添加MITK特定的小部件，如QmitkStdMultiWidget用于显示医学图像

5. 实现MITK功能
   - 创建MITK数据节点和数据存储
   ```cpp
   mitk::DataNode::Pointer node = mitk::DataNode::New();
   mitk::DataStorage::Pointer dataStorage = mitk::StandaloneDataStorage::New();
   ```
   - 加载和显示医学图像
   ```cpp
   mitk::IOUtil::Load(filename, *dataStorage);
   ```

6. 集成MITK渲染
   - 在Qt窗口中嵌入MITK渲染窗口
   - 使用QmitkRenderWindow类来显示MITK的2D和3D视图

7. 实现交互功能
   - 使用Qt信号和槽机制
   - 实现MITK的交互器和工具

8. 数据处理
   - 使用MITK的滤波器和算法进行图像处理
   - 实现自定义的数据处理逻辑

9. 插件开发（可选）
   - 如果需要，可以将功能模块化为MITK插件
   - 使用MITK的插件框架创建可动态加载的组件

10. 错误处理和日志
    - 使用Qt的调试工具和MITK的日志系统
    - 实现适当的错误处理机制

11. 性能优化
    - 使用Qt的多线程功能处理耗时操作
    - 优化MITK数据处理和渲染性能

12. 打包和部署
    - 使用Qt的部署工具打包应用
    - 确保所有MITK依赖库都正确包含

13. 测试
    - 编写单元测试和集成测试
    - 使用Qt Test框架和MITK的测试工具

14. 文档
    - 使用Doxygen为代码生成文档
    - 编写用户手册和开发者指南

示例代码（主窗口类）:

```cpp
#include <QMainWindow>
#include <mitkStandaloneDataStorage.h>
#include <QmitkRenderWindow.h>

class MainWindow : public QMainWindow
{
    Q_OBJECT

public:
    MainWindow(QWidget *parent = nullptr);

private:
    mitk::DataStorage::Pointer m_DataStorage;
    QmitkRenderWindow* m_RenderWindow;

    void setupUi();
    void loadImage(const QString& filename);
};
```

实现文件:

```cpp
#include "mainwindow.h"
#include <mitkIOUtil.h>

MainWindow::MainWindow(QWidget *parent)
    : QMainWindow(parent)
{
    setupUi();
    m_DataStorage = mitk::StandaloneDataStorage::New();
    // 设置渲染窗口的数据存储
    m_RenderWindow->GetRenderer()->SetDataStorage(m_DataStorage);
}

void MainWindow::setupUi()
{
    // 创建和设置UI组件
    m_RenderWindow = new QmitkRenderWindow(this);
    setCentralWidget(m_RenderWindow);
    // 添加菜单、工具栏等
}

void MainWindow::loadImage(const QString& filename)
{
    try {
        mitk::IOUtil::Load(filename.toStdString(), *m_DataStorage);
        m_RenderWindow->GetRenderer()->RequestUpdateAll();
    } catch (mitk::Exception& e) {
        // 处理错误
    }
}
```

这个框架提供了一个基础，你可以在此基础上根据具体需求进行扩展和定制。记住要适当处理内存管理和异常，并确保UI响应性能良好。