libsvm-mat-加强工具箱介绍

转载自:http://bbs.sciencenet.cn/blog-348249-272606.html

libsvm-mat-加强工具箱介绍 by faruto

最终版本号:

libsvm-mat-2.89-3[farutoUltimateVersion2.0]

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libsvm-mat-加强工具箱介绍

由于libsvm的matlab版本的工具箱libsvm-mat并没有给出寻参的函数模块,而无论利用libsvm工具箱进行分类还是回归,参数的选取是十分重要的,鉴于此libsvm-mat-加强工具箱在libsvm-mat-2.89-3的基础上给出相应的辅助函数插件,方便用户来选取最佳的参数,该加强工具箱可以在MATLAB中文论坛上下载,现对该加强工具箱里主要的辅助函数插件的接口进行介绍,所有的源代码可以到MATLAB中文论坛下载并查看。

归一化函数:scaleForSVM

[train_scale,test_scale,ps]= scaleForSVM(train_data,test_data,ymin,ymax)

输入:

train_data:训练集,格式要求与svmtrain相同。

test_data:测试集,格式要求与svmtrain相同。

ymin,ymax:归一化的范围,即将训练集和测试都归一化到[ymin,ymax],这两个参数可不输入,默认值为ymin=0,ymax=1,即默认将训练集和测试都归一化到[0,1]。

输出:

train_scale:归一化后的训练集。

test_scale:归一化后的测试集。

ps:归一化过程中的映射(方便反归一化使用)。

pca降维预处理函数:pcaForSVM

[train_pca,test_pca] = pcaForSVM(train_data,test_data,threshold)

输入:

train_data:训练集,格式要求与svmtrain相同。

test_data:测试集,格式要求与svmtrain相同。

threshold:对原始变量的解释程度([0,100]之间的一个数),通过该阈值可以选取出主成分,该参数可以不输入,默认为90,即选取的主成分默认可以达到对原始变量达到90%的解释程度。

输出:

train_pca:进行pca降维预处理后的训练集。

test_pca:进行pca降维预处理后的测试集。

网格参数寻优函数(分类问题):SVMcgForClass

[bestCVaccuracy,bestc,bestg]=

SVMcgForClass(train_label,train,

cmin,cmax,gmin,gmax,v,cstep,gstep,accstep)

输入:

train_label:训练集的标签,格式要求与svmtrain相同。

train:训练集,格式要求与svmtrain相同。

cmin,cmax:惩罚参数c的变化范围,即在[2^cmin,2^cmax]范围内寻找最佳的参数c,默认值为cmin=-8,cmax=8,即默认惩罚参数c的范围是[2^(-8),2^8]。

gmin,gmax:RBF核参数g的变化范围,即在[2^gmin,2^gmax]范围内寻找最佳的RBF核参数g,默认值为gmin=-8,gmax=8,即默认RBF核参数g的范围是[2^(-8),2^8]。

v:进行Cross Validation过程中的参数,即对训练集进行v-fold Cross Validation,默认为3,即默认进行3折CV过程。

cstep,gstep:进行参数寻优是c和g的步进大小,即c的取值为2^cmin,2^(cmin+cstep),…,2^cmax,,g的取值为2^gmin,2^(gmin+gstep),…,2^gmax,默认取值为cstep=1,gstep=1。

accstep:最后参数选择结果图中准确率离散化显示的步进间隔大小([0,100]之间的一个数),默认为4.5。

输出:

bestCVaccuracy:最终CV意义下的最佳分类准确率。

bestc:最佳的参数c。

bestg:最佳的参数g。

网格参数寻优函数(回归问题):SVMcgForRegress

[bestCVmse,bestc,bestg]=

SVMcgForRegress(train_label,train,

cmin,cmax,gmin,gmax,v,cstep,gstep,msestep)

其输入输出与SVMcgForClass类似,这里不再赘述。

利用PSO参数寻优函数(分类问题):psoSVMcgForClass

[bestCVaccuracy,bestc,bestg,pso_option]=

psoSVMcgForClass(train_label,train,pso_option)

输入:

train_label:训练集的标签,格式要求与svmtrain相同。

train:训练集,格式要求与svmtrain相同。

pso_option:PSO中的一些参数设置,可不输入,有默认值,详细请看代码的帮助说明。

输出:

bestCVaccuracy:最终CV意义下的最佳分类准确率。

bestc:最佳的参数c。

bestg:最佳的参数g。

pso_option:记录PSO中的一些参数。

利用PSO参数寻优函数(回归问题):psoSVMcgForRegress

[bestCVmse,bestc,bestg,pso_option]=

psoSVMcgForRegress(train_label,train,pso_option)

其输入输出与psoSVMcgForClass类似,这里不再赘述。

利用GA参数寻优函数(分类问题):gaSVMcgForClass

[bestCVaccuracy,bestc,bestg,ga_option]=

gaSVMcgForClass(train_label,train,ga_option)

输入:

train_label:训练集的标签,格式要求与svmtrain相同。

train:训练集,格式要求与svmtrain相同。

ga_option:GA中的一些参数设置,可不输入,有默认值,详细请看代码的帮助说明。

输出:

bestCVaccuracy:最终CV意义下的最佳分类准确率。

bestc:最佳的参数c。

bestg:最佳的参数g。

ga_option:记录GA中的一些参数。

利用GA参数寻优函数(回归问题):gaSVMcgForRegress

[bestCVmse,bestc,bestg,ga_option]=

gaSVMcgForRegress(train_label,train,ga_option)

其输入输出与gaSVMcgForClass类似,这里不再赘述。

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Matlab的libsvmmatfaruto版本Ver2-libsvm-mat-2.89-3-farutoVer2.rar libsvm-mat-2.89-3-farutoVer2 libsvm-mat-2.89-3-farutoVer2.rar 此次更新加进了,用PSO寻找SVM参数c和g的函数. 1.jpg 而且这次关于psoSVMcgForClass.m的编写,里面参数的设置采用的是用结构体的方式比较方便,这种方式我第一次采用,感觉很好..很好.. 采用这种结构体的方式可以避免过多的参数才函数接口中显示,很方便个人感觉,以前我自己没有这么编过. ANN的matlab自带的程序里面的参数设置都是采用这种手法.基本.... 程序 的一小段: function [bestCVaccuarcy,bestc,bestg,pso_option] = psoSVMcgForClass % psoSVMcgForClass % by faruto % 2009.09.22 %% 参数初始化 if nargin < 3     pso_option = struct('c1',1.5,'c2',1.7,'maxgen',200,'sizepop',20, ...                     'k',0.6,'wV',1,'wP',1,'v',3, ...                      'popcmax',10^2,'popcmin',10^,'popgmax',10^3,'popgmin',10^); end % c1:初始为1.5,pso参数局部搜索能力 % c2:初始为1.7,pso参数全局搜索能力 % maxgen:初始为200,最大进化数量 % sizepop:初始为20,种群最大数量 % k:初始为0.6,速率和x的关系 % wV:初始为1,速率更新公式中速度前面的弹性系数 % wP:初始为1,种群更新公式中速度前面的弹性系数 % v:初始为3,SVM Cross Validation参数 % popcmax:初始为100,SVM 参数c的变化的最大值. % popcmin:初始为0.1,SVM 参数c的变化的最小值. % popgmax:初始为1000,SVM 参数g的变化的最大值. % popgmin:初始为0.01,SVM 参数c的变化的最小值.
libsvm English: libsvm_options: -s svm_type : set type of SVM (default 0) 0 -- C-SVC 1 -- nu-SVC 2 -- one-class SVM 3 -- epsilon-SVR 4 -- nu-SVR -t kernel_type : set type of kernel function (default 2) 0 -- linear: u'*v 1 -- polynomial: (gamma*u'*v + coef0)^degree 2 -- radial basis function: exp(-gamma*|u-v|^2) 3 -- sigmoid: tanh(gamma*u'*v + coef0) 4 -- precomputed kernel (kernel values in training_instance_matrix) -d degree : set degree in kernel function (default 3) -g gamma : set gamma in kernel function (default 1/k) -r coef0 : set coef0 in kernel function (default 0) -c cost : set the parameter C of C-SVC, epsilon-SVR, and nu-SVR (default 1) -n nu : set the parameter nu of nu-SVC, one-class SVM, and nu-SVR (default 0.5) -p epsilon : set the epsilon in loss function of epsilon-SVR (default 0.1) -m cachesize : set cache memory size in MB (default 100) -e epsilon : set tolerance of termination criterion (default 0.001) -h shrinking: whether to use the shrinking heuristics, 0 or 1 (default 1) -b probability_estimates: whether to train a SVC or SVR model for probability estimates, 0 or 1 (default 0) -wi weight: set the parameter C of class i to weight*C, for C-SVC (default 1) -v n: n-fold cross validation mode ========================================================== Chinese: Options:可用的选项即表示的涵义如下   -s svm类型:SVM设置类型(默认0)   0 -- C-SVC   1 --v-SVC   2 – 一类SVM   3 -- e -SVR   4 -- v-SVR   -t 核函数类型:核函数设置类型(默认2)   0 – 线性:u'v   1 – 多项式:(r*u'v + coef0)^degree   2 – RBF函数:exp(-r|u-v|^2)   3 –sigmoid:tanh(r*u'v + coef0)   -d degree:核函数中的degree设置(针对多项式核函数)(默认3)   -g r(gama):核函数中的gamma函数设置(针对多项式/rbf/sigmoid核函数)(默认1/ k)   -r coef0:核函数中的coef0设置(针对多项式/sigmoid核函数)((默认0)   -c cost:设置C-SVC,e -SVR和v-SVR的参数(损失函数)(默认1)   -n nu:设置v-SVC,一类SVM和v- SVR的参数(默认0.5)   -p p:设置e -SVR 中损失函数p的值(默认0.1)   -m cachesize:设置cache内存大小,以MB为单位(默认40)   -e eps:设置允许的终止判据(默认0.001)   -h shrinking:是否使用启发式,0或1(默认1)   -wi weight:设置第几类的参数C为weight*C(C-SVC中的C)(默认1)   -v n: n-fold交互检验模式,n为fold的个数,必须大于等于2   其中-g选项中的k是指输入数据中的属性数。option -v 随机地将数据剖分为n部分并计算交互检验准确度和均方根误差。以上这些参数设置可以按照SVM的类型和核函数所支持的参数进行任意组合,如果设置的参数在函数或SVM类型中没有也不会产生影响,程序不会接受该参数;如果应有的参数设置不正确,参数将采用默认值。

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