R语言广义线性模型Logistic回归模型列线图分析(nomogram)

本文介绍了如何使用R语言进行广义线性模型的Logistic回归,并展示了如何构建列线图(nomogram)进行数据分析。通过具体案例,如胃肠道间质瘤的无复发生存率模型和低出生体重儿模型,阐述了列线图在预测和解释模型中应用,以及校准过程。
摘要由CSDN通过智能技术生成

R语言广义线性模型Logistic回归模型列线图分析(nomogram)

我们来看图说话:

gist是一种胃肠道间质瘤,作者构建了无复发生存率的logistic回归模型。

并构建了如下的列线图或者nomogram

现在假设新来了以为患者:我们知道的信息如下,size为5,Mltotic index 为最右侧值、site为最左侧值;

好了开始查表,就是查nomogram图。

那么如果size对应的是5,那么他对应的分数就是30,MItotic index为最右侧值,则对应的分数为80分,而site对应的是最左侧、则它对应的得分为0分;

那么他们的家和就是:30+80+0=110, 

我们获得了总分,而总分就是total points中的一个点,那么通过total points 和它下方了两个概率的关系我们就获得2年和5年的胃肠道间质瘤无复发生存率。

#Logistic回归案例 5 低出生体重儿列线图
library(foreign) 
library(rms)

mydata<-read.spss("lweight.sav")
mydata<-as.data.frame(mydata)
head(mydata)

mydata$low <- ifelse(mydata$low =="低出生体重",1,0)
mydata$race1 <- ife

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