抑制性土壤

理解植物对土壤微生物的反应仍然在起步阶段。本文作者重点关注番茄，测试植物生长在自然土壤表现出不同的对土壤微生物的反应。

通过使用转录组学，蛋白组学以及生物农药我们描述了对番茄镰刀根腐病感病和发病的两种不同基因型生长在人工生长基质以及两个自然土壤（镰刀菌抑制性土壤以及镰刀菌感病土壤）。自然土壤影响番茄的方式包括调节与氧化应激反应，苯酚的合成；木质素沉积和植物先天免疫相关的代谢途径，尤其是在抑制性土壤中。在无菌土壤的番茄栽培实验中，总苯酚和木质素显著性下降。当接种了菌根真菌之后对植物本地和系统性反应尤其明显。在抗病的基因型中，接种了病原真菌的植物展现出了较少的。而感病的基因型只有生长在抑制性土壤中的时候才表现出对病原菌的抵抗力。

这种在番茄中检测到的警戒状态，揭示了一个全新的运行机制，那就是植物所在自然土壤以及土壤微生物是植物响应主要驱动因子之一。当只种植单一的作物时，作物更容易爆发好几种不同的病害。人们通常用抗病育种，化学农药来阻碍或者激活植物对病菌的防御系统。

## 突破点1 很少有研究去阐述植物是怎么建立起他们自身的微生物组的(Lebeis et al., 2015)，并且微生物组和植物的基因型营养物质的吸收之间的关系还并不清楚(Horton et al., 2014; Castrillo et al., 2017; Hacquard et al.,2017)。为了解开他们的复杂关系，作者选取了模式作物番茄为研究对象。作者的假说是不同土壤中的微生物会触发植物不同的响应，并且不同的植物基因型也会不同的土壤和微生物产生不同的反应。通过鉴定植物响应的主要因子，这样的假说有助于让我们更清楚描述植物在田地的响应情况，而不是在实验室的响应情况。

实验设计：

为了验证假说，作者选取了一个抗FOL的番茄品种，一个感FOL的品种。将他们种在两块地理位置不同的地方。在这两个地方分别种在抑制性土壤以及感病土壤中，这两种土具有相似的灰度以及营养成分。 作者在用高温蒸汽消毒的玻璃温室中种植的番茄作为对照。通过转录组测序分析，通过与在高温灭菌土壤的植物作为对比，展示了本地土壤成分可以通过增强防御基因的响应来拉响植物防御警报的前沿哨所（具体实验操作流程！！）。抗病性的抑制土壤确实在提高抗病性上更有效。支持了不同的土壤微生物可能介导不同的植物防御反应的假说。相反，不同植物基因型可能会响应不同的土壤或者不同微生物群落的假说并没有被验证。通过接种AMF真菌在灭菌土壤中也产生了类似的响应，意味着土壤微生物可能是植物防御响应的第一驱动因素。只有在病原菌的压力下植物的基因型才发挥相应的作用。本研究表明生物学作用比非生物学作用更能影响本地土壤生长的番茄的特异性反应。

参考文献

Chialva, M., di Fossalunga, A. S., Daghino, S., Ghignone, S., Bagnaresi, P., Chiapello, M., ... & Bonfante, P. (2018). Native soils with their microbiotas elicit a state of alert in tomato plants.  New Phytologist .