R 语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂,涉及众多统计分析方法。
暨融合《R语言基础》、《tidyverse数据清洗》、《多元统计分析》、《随机森林模型》、《回归及混合效应模型》、《结构方程模型》、《统计结果作图》
专题一:R入门及Rstudio
1) R及Rstudio介绍:背景、软件及程序包安装、基本设置等
2) R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等
3) R语言数据文件读取、整理及存储等
4) R语言基础绘图(含ggplot):基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储
专题二:群落数据准备及探索分析
1) 生物群落数据准备:物种组成、环境变量、物种功能属性、系统发育树等
2) 生物群落数据检查:缺失值和离群值(outliers