使用 wtdbg2进行基因组组装,并使用 minimap2 和 bwa 进行纠错处理
这个网上的教程也很多,纠错软件也很多,有用racon + polin 的,也用用 minimap2+bwa的,熟练掌握一个能将流程跑通即可,也可以混合使用。一般迭代两三次进行纠错就好了。使用 wtdbg2 进行基因组的组装,软件安装这里就不介绍了,流程都一样。可以用conda安装,也可以自己去下载安装包,源码编译安装,安装完记得添加环境变量。下面介绍一下 wtdbg2 对三代 基因组数据的组装,网上有很多教程,但是都不够完整,之前看了陈连福的教程跑完但是没有用二代和三代数据进行纠错处理。...
原创
2022-08-11 23:08:58 ·
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