K-mer频率分布图代码实现

软件:kmergenie

下载地址:http://kmergenie.bx.psu.edu/

安装:

tar zxvf kmergenie-1.7051.tar.gz
cd kmergenie-1.7051
make

使用:

ls *fastq.gz > read_file.txt
./kmergenie read_file.txt      #得根据kmergenie的安装存放路径使用

结果:会生成一个html文件

每个K值对应的频率分布直方图都画出来了,非常的好用

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