生物信息学笔记

最新推荐文章于 2020-05-17 17:02:36 发布
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分类专栏： 生物信息学 文章标签： 生物信息学
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生物信息学

交叉学科

莱布尼兹首次提出计算机的概念：数理逻辑、数学、计算机均处于一个统一的目的，即人的思维过程的演算化、计算机化、以至于在计算机上实现。

AugustRed
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专栏目录
生物信息学习笔记整理
49
08-16 1392
做了不少练习，整理一下以前的经验。 主要是归纳一些模块化的东西，提取一些常用的函数还有一些小tricky# split的用法 str = "Line1-abcdef \nLine2-abc \nLine4-abcd" print (str.split( )) print (str.split(' ', 1)) # 从头开始切一刀 list1 = [ [1,5,7], [10,3, 4], [6,
生物信息学Bioinformatics学习笔记（一）
cling5899的博客
03-21 7517
文章目录生物信息学第一章 绪论History（根据19年的一份综述）生物信息学的研究内容生物信息学的应用领域第二章 模式生物和生物信息学数据库资源第一节 模式生物测序第二节 三大核酸数据库第三节 蛋白质数据库第三章 生物信息学数据库查询第一节 生物信息数据库的储存第二节 GenBank中序列的获取第三节 数据库文献的检索第四章 序列分析第一节 序列比对的内容Sequence Alignment第二节 BLAST应用示例第五章 进化与系统发生分析第一节 生物进化的分子基础第二节 基本概念第三节 系统发生树的构
生物信息学学习笔记
郝玉杰的专栏
01-06 651
正在努力学习matlab和生物信息学。 原来matlab网站上，可以下载一些示例。 https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/fileexchange/32427-fast-approximate-entropy?s_tid=srchtitle 注册一个用户后，就可以把例子下载下来。...
氨基酸序列碎裂by离子-生物信息学笔记
weixin_43869337的博客
08-28 4404
b离子 y离子 多肽有N端和C端，根据多肽的碎裂位置来定义b离子y离子。个人理解的规则如下： 破碎后缺失N端的叫b离子，破碎后缺失C端的叫y离子
生物信息基础 学习笔记（1）
Fluence_YHL
08-01 1315
生物信息基础  学习笔记 (1)——穷举搜索 部分酶切问题：   已知多重集，求原来的集合 X，可以有多个 。 例子：X = { 0 ， 2 ， 4 ， 7 ，10 }，则 = { 2 , 2 , 3 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7, 8 , 10 } 不同的 X 可能产生相同的  , 这样的 X 称为同效集。 现在已知 ，要求所有的 X 。 不实用的限制酶切作图算法 ...
生物信息学课程学习笔记第四版2022版
最新发布
04-23
### 生物信息学的概念与发展历程 #### 一、生物信息学的发展历史 生物信息学作为一门新兴学科，其发展经历了几个关键阶段。自20世纪70年代以来，随着分子生物学技术的进步，尤其是DNA测序技术的发展，生物信息学...
bioinformatics-notes:哥德堡大学化学与分子生物学系生物信息学人员的随机笔记
05-10
生物信息学笔记 建立该存储库的目的是托管各种最佳实践和有关生物信息学所有内容的参考说明。 哥德堡大学化学与分子生物学系研究人员 ＃＃什么？ 脚本包含或多或少的纯示例脚本，可用于各种操作 教程包含有关如何...
生物学笔记
02-23
HTML，虽然通常与网页设计和技术文档呈现有关，但它在这个生物学笔记的上下文中可能是指一种用于组织和展示生物学信息的方式。下面，我们将深入探讨HTML如何在生物学教育和研究中发挥重要作用，并结合"生物学笔记"这...
biojupies:通过用户界面自动生成量身定制的生物信息学Jupyter笔记本
05-15
BioJupies 通过用户界面（ ）自动生成Jupyter Notebook，用于RNA序列数据分析。 可在获得RNA-seq分析插件的源代码。 概述 什么是BioJupies？ BioJupies是一个Web服务器，它使用户可以通过直观的界面从RNA-seq数据...
生物信息学初学——山大公开课笔记
weixin_42953727的博客
08-20 2217
2019年8月20日，南京闷热 生物信息学研究对象 核酸 测序及应用；基因序列注释；基因预测；核酸序列比对；核酸数据库；比较基因组学；宏基因组学；基因进化；RNA结构预测；等 蛋白质 蛋白质数据库；蛋白质序列比对；二/三级结构预测；相互作用分析；分子动力学模拟；分子对接；蛋白质组学；等 其他 代谢网络模拟；数据挖掘分析；序列算法开发；计算进化生物学；生物多样性研究；等 课程提纲 生物数据库 序列比...
生物信息学札记（第三版）
09-17
生物信息学札记（第三版）
生物信息学札记 第三版 pdf
02-26
生物信息学札记 第三版 有需要的可以看看，不错的资料！！！！
北京大学生物信息学课程笔记（第一 二周课程笔记）
xjw的博客
03-20 1320
课程笔记第一课第二课 第一课 课程涉及什么内容 序列比对算法，如何在大量的基因序列中找到与我最相似的–blast 序列统计工具 如何基于已知数据预测未知 通过马尔可夫模型预测 如何回帖到参考基因组鉴定一个人的遗传变异 如何计算基因表达差异 案例实践 什么是生物信息学 染色体内的基因组就像是人的说明书 四个碱基ATCG，so simple， yet so mysterious. 生物序...
北京大学生物信息学笔记-第一周-生物信息学概述
GUET_DM_LQ的博客
05-17 654
什么生物信息学？ [1] 基因组：生命手册 [2] 人类基因组有31亿碱基对 [3] 碱基编码基因占~2.9% [4] ~97%的基因以前被称为是"垃圾“ [5] 他们包含编码指令的调节元素——什么时候，在哪里，制造多少蛋白质 Bioinformatics: an interdisciplinary field that develops and applies computer and computational technologies to study biomedical questions 生物信
生物信息学算法笔记
热门推荐
FanJin的博客
05-19 1万+
入门生物信息学，选了一条比较难的路，直接从底层算法开始，这种做法其实不太明智。读了"Algorithms on Strings, Trees and Sequences"，一本厚厚的算法书，后半部分其实读得有些粗糙。今天读完了第一遍，总的来说还是有些收获，将笔记记录于此。 全书总共分为四部分：基本字符串算法、后缀树算法、非精确匹配算法、映射与测序。基本字符串算法以KMP为代表，这个是基本功，而且...
生物信息学基本知识笔记
GeekFocus
02-21 2307
Bam文件 SAM（The Sequencing Alignment/Map Format）是bwa比对软件的标准输出文件，是纯文本文件，bwa的开发者设计了一种比gz更加高效的压缩算法，BAM的文件大小差不多只有原来的1/6。 header头文件 @HD是必须的标准头文件；@SQ参考序列染色体信息，顺序必须和参考序列一致；@RG重要Read group信息，通常包含测序平台测序文库和样本id...
《生物信息学学习感悟》读后感
Attano的博客
10-06 7299
生物信息学，是一门综合学科。涉及到数学，生物学和计算机的内容。但在我看来，计算机的基础需要，但要求不是很高，关键是要有很好的生物学知识，包括遗传学的、生物化学的、发育生物学的、分子生物学的、植物生理学的知识等等，也就说需要达到这样的一个要求：在进行数据分析时，能对各种分析结果进行生物学的评价，并给出最优的分析策略。同时也应该有纯熟的数理基础，包括统计学的、拓扑学的，这样才能把待分析的问题转换成可计
R语言小白来求助各位！！！
Shaunachiu的博客
11-28 470
求助啊各位大神 哭 伤心 大哭 不开心 流泪 桑心哭 伤心 大哭 不开心 流泪 桑心哭 伤心 大哭 不开心 流泪 老师让我用Decipher包酶切一段fasta序列，用三个酶切，然后找出目标片段的长度（一头是酶1一头是酶3和一头是酶2一头是酶3的，然后他给了我思路，我自己编写了前半段，总报错，后半段完全没思路。各位大神能帮我看看吗？感觉要被锤了崩溃 抓狂 疲惫 苦逼） 崩溃 抓狂 疲惫 苦逼 打开...
生物信息学实践：php+mysql实现的在线答题与有根树状图解析
文件的部分内容提到了《生物信息学札记》的三个不同版本，这是樊龙江教授关于生物信息学教学和研究的笔记，涵盖了从基础理论到最新技术的发展，如小RNA分析和遗传多态性检测。这些章节包括生物信息学的通论、分子...
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