生物信息学Bioinformatics学习笔记（一）

生物信息学

第一章 绪论

学习bioinformatics需掌握的background

1. 分子生物学/基因工程
2. 统计学/模型/算法
3. Lunix/R/Python

生物信息-DNA（ATCG）、RNA（AUCG）、蛋白质（ABCD…)

核酸生物信息

​ 编码序列（外显子）、非编码序列（调控序列和某些内含子）

​ 重复序列、垃圾序列（冗余信息）

**定义：**采用信息科学技术，借助数学、生物学的理论、方法，对各种生物信息（包括核酸、蛋白质等）的收集、加工、储存、分析、解释的一门学科。

History（根据19年的一份综述）

A brief history of bioinformatics 原文

DOI号：10.1093/bib/bby063

1950–1970: The origins

1970–1980: Paradigm shift from protein to DNA analysis

1980–1990: Parallel advances in biology and computer science

1990–2000: Genomics, structural bioinformatics and the information superhighway

2000–2010: High-throughput bioinformatics

2010–Today: Present and future perspectives

生物信息学的研究内容

1.开发新的统计学方法和算法

2.生物学数据库的建立、管理、使用。

3.生物学数据的分析、解释和预测。

生物信息学的应用领域

1.基因组序列的测定

2.基因组的注释

3.发现并确定新基因

4.基因表达、调控研究

5.分子进化研究

6.生物大分子结构模拟与药物设计

7.疾病的治疗和预防

第二章 模式生物和生物信息学数据库资源

第一节 模式生物测序

模式生物