Kmeans聚类分析-julia实现

于 2024-08-17 17:43:43 发布
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分类专栏： Julia数据分析 文章标签： kmeans julia 机器学习
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版权 
using TyMachineLearning
using CSV
using DataFrames
using QuantEcon
using TyPlot 
file = joinpath(pkgdir(TyMachineLearning), "data/Classification/iris.csv")
iris = CSV.read(file, DataFrame; header=false)
#划分数据集
X = iris[:, 1:4]

rename!(iris, [:Column5 => :SH])
X1, y1, convs = convent_columns(iris, "SH")
fgdata_x1 = Matrix(X1.values)
fgdata_y1 = Array(y1.values)
scatter(X[:, 3], X[:, 4]; c=fgdata_y1, filled="true")
xlabel("PL")
ylabel("PW")
title("Iris Data")

卡卡_R-Python
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轮廓系数越接近于 1 越好，负数 则表示聚类 效果非常差。如果一个簇中的大多数样本 具有比较高的轮廓系数，则 簇会有较高的 总轮廓系数，则整个数据集的 平均轮廓系数越高，则 聚类是合适的。如果 许多样本点具有低轮廓系数 甚至负值，则 聚类 是不合适的，聚类的超参数 K 可能设定得 太大或者太小。
Julia调用Matlab, Python以及R的微分方程求解器
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换言之，其提供了一些MATLAB中求解器，包括ode23, ode45, ode113, ode23s, ode23t, ode23tb, ode15s, ode15i。deSolveDiffEq.jl可调用：lsoda ,lsode ,lsodes ,lsodar ,vode ,daspk ,euler ,rk4 ,ode23 ,ode45 ,radau ,bdf ,bdf_d ,adams ,impAdams ,impAdams_d。这三个包需要在github上下载安装。
数据平衡的艺术：解锁机器学习中的类别不平衡难题
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K-means是常用的聚类算法之一，它的主要思想是将数据点分为K个簇，使得同一簇内的点相似度较高，不同簇之间的点相似度较低。在scikit-learn中，KMeans聚类算法已经实现，可以方便地进行聚类操作。 本文将介绍使用scikit-learn中的KMeans聚类算法进行聚类的步骤和实现方法，并介绍MiniBatchKMeans的使用。 ## 1. 数据准备 我们先生成一个随机数据集，用于演示KMeans聚类： ```python import numpy as np # 生成随机数据 np.random.seed(0) X = np.random.randn(1000, 2) # 生成1000个二维数据点 ``` ## 2. 模型训练 接下来，我们使用KMeans模型对数据进行聚类： ```python from sklearn.cluster import KMeans # 构建模型 kmeans = KMeans(n_clusters=3, random_state=0) # 训练模型 kmeans.fit(X) ``` 这里选择将数据分为3个簇，可以根据实际情况进行调整。训练完成后，我们可以查看簇中心点的位置： ```python print(kmeans.cluster_centers_) ``` 输出： ``` [[ 0.05161133 -0.96525049] [ 1.06359705 -0.02646225] [-0.9680658 0.04252211]] ``` ## 3. 预测和评估 训练完成后，我们可以使用训练好的模型对新数据进行预测： ```python # 预测新数据 y_pred = kmeans.predict(X) ``` 对于聚类算法，我们可以使用轮廓系数（Silhouette Coefficient）评估聚类效果。轮廓系数是一种衡量聚类质量的指标，取值范围在[-1, 1]之间，越接近1表示聚类效果越好。在scikit-learn中，可以使用metrics.silhouette_score来计算轮廓系数： ```python from sklearn import metrics # 计算轮廓系数 score = metrics.silhouette_score(X, y_pred) print(score) ``` 输出： ``` 0.6011942331016043 ``` ## 4. MiniBatchKMeans KMeans聚类算法的一个问题是它对于大规模数据的聚类会比较慢。因此，scikit-learn中还提供了MiniBatchKMeans算法，它可以加快聚类速度。 MiniBatchKMeans的使用方法与KMeans类似： ```python from sklearn.cluster import MiniBatchKMeans # 构建模型 mbkmeans = MiniBatchKMeans(n_clusters=3, random_state=0) # 训练模型 mbkmeans.fit(X) # 预测新数据 y_pred = mbkmeans.predict(X) # 计算轮廓系数 score = metrics.silhouette_score(X, y_pred) print(score) ``` 需要注意的是，MiniBatchKMeans算法在聚类效果上可能会稍微劣于KMeans算法，但是速度更加快捷。在处理大规模数据时，可以优先考虑使用MiniBatchKMeans算法。 本文介绍了使用scikit-learn中的KMeans聚类算法进行聚类的步骤和实现方法，并介绍了MiniBatchKMeans的使用。在实际应用中，可以根据实际情况选择不同的聚类算法和参数。
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