学习K-means聚类算法

本文主要讨论k-means 聚类算法背后的基础知识和数学原理，以及如何在 scikit-learn 中实现它。

聚类（或聚类分析）是一种技术，允许我们找到相似对象的群组，这些对象彼此之间的关系比与其他群组中的对象更密切。聚类的商业应用示例包括根据不同主题对文档、音乐和电影进行分组，或者基于共同购买行为找到共享类似兴趣的客户，作为推荐引擎的基础。

在本文中，我们将学习关于最流行的聚类算法之一：k-means 的知识，这在学术界和工业界都被广泛使用。我们将涵盖以下内容：

• k-means 聚类的基本概念

• k-means 算法背后的数学原理

• k-means 的优缺点

• 如何使用 scikit-learn 在样本数据集上实现该算法

• 如何可视化聚类结果

• 如何使用肘部法则选择最优的 k 值

K-Means聚类基础

正如我们将看到的那样，与其他聚类算法相比，k-means 算法极其易于实现并且在计算上非常高效，这可能解释了它的流行。k-means 算法属于原型聚类的一种。

原型聚类意味着每个聚类由一个原型表示，该原型可以是具有连续特征的相似点的质心（平均值），或者在分类特征的情况下是最具代表性或最频繁出现的点（中心点）。

虽然 k-means 在识别球形状的簇方面非常出色，但该聚类算法的一个缺点是我们必须事先指定簇的数量 k。对 k 进行不恰当的选择可能导致聚类性能不佳 —— 我们将在本教程后面讨论如何选择 k。

虽然 k-means 聚类可以应用于高维数据，但为了可视化的目的，我们将使用一个简单的二维数据集来演示以下示例。

import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.datasets import make_blobs

# create dataset
X, y = make_blobs(
   n_samples=150, n_features=2,
   centers=3, cluster_std=0.5,
   shuffle=True, random_state=0
)

# plot
plt.scatter(
   X[:, 0], X[:, 1],
   c='white', marker='o',
   edgecolor='black', s=50
)
plt.show()

我们刚刚创建的数据集包含了150个随机生成的点，大致分成了三个密度较高的区域，这通过二维散点图进行了可视化。

在聚类的实际应用中，我们没有关于这些样本的任何真实分类信息（即作为经验证据而非推断提供的信息）；否则，它将属于监督学习的范畴。因此，我们的目标是根据它们的特征相似性将样本分组，这可以通过 k-means 算法来实现，其主要步骤如下四步：

1. 从样本点中随机选择k个中心点作为初始聚类中心

2. 将每个样本分配给最近的中心点其中

3. 将每个中心点移动到被分配给它的样本的中心

4. 重复步骤 2 和 3，直到聚类分配不再变化，或达到用户定义的容差或最大迭代次数

可视化上述步骤：

现在，下一个问题是我们如何衡量对象之间的相似性？我们可以将相似性定义为距离的相反，对于具有连续特征的样本聚类，常用的距离是在 m 维空间中两点 x 和 y 之间的平方欧氏距离。

索引 j 指的是样本点 x 和 y 的第 j 维（特征列）。

下述的方程中，我们将使用上标 i 和 j 分别表示样本索引和簇索引。

基于这个欧氏距离度量，我们可以将 k-means 算法描述为一个简单的优化问题，即通过迭代的方式最小化簇内平方误差和（Sum of Squared Errors, SSE），有时也称为簇的惯性。

这里，

是第个聚类的中心

以及，

请注意，当我们使用欧氏距离度量将 k-means 应用于真实世界的数据时，我们希望确保特征在相同的尺度上进行测量，必要时可以应用 z-score 标准化或 min-max 缩放。

scikit-learn实现K-means聚类

现在我们已经学习了 k-means 算法的工作原理，让我们使用 scikit-learn 的 cluster 模块中的 KMeans 类将其应用于我们的示例数据集。

from sklearn.cluster import KMeans

km = KMeans(
    n_clusters=3, init='random',
    n_init=10, max_iter=300, 
    tol=1e-04, random_state=0
)
y_km = km.fit_predict(X)

上述代码，我们将所需的簇数设置为 3。我们设置 n_init=10，以便独立运行 k-means 聚类算法 10 次，每次使用不同的随机中心点选择最终模型为 SSE 最低的模型。通过 max_iter 参数，我们指定每次单独运行的最大迭代次数（这里是 300）。

请注意，scikit-learn 中的 k-means 实现在达到最大迭代次数之前，如果收敛了会提前停止。然而，如果选择了相对较大的 max_iter 值，可能 k-means 在特定运行中无法达到收敛，这可能会导致计算开销较大。

处理收敛问题的一种方法是选择较大的 tol 值，该参数控制在簇内平方误差变化方面的容差以宣布收敛。在前面的代码中，我们选择了容差为 1e-04（等于 0.0001）。

k-means 的一个问题是可能会出现一个或多个空簇。然而，在当前的 scikit-learn 实现中已经考虑了这个问题。如果一个簇为空，算法会搜索距离空簇质心最远的样本点。然后，它将重新分配质心为这个最远的点。

现在们已经预测了聚类标签 y_km，现在让我们可视化 k-means 算法在数据集中识别的聚类以及这些聚类的中心点。这些聚类的中心点存储在拟合后的 KMeans 对象的 cluster_centers_ 属性下：

# 聚类以及聚类中心可视化
plt.scatter(
    X[y_km == 0, 0], X[y_km == 0, 1],
    s=50, c='lightgreen',
    marker='s', edgecolor='black',
    label='cluster 1'
)

plt.scatter(
    X[y_km == 1, 0], X[y_km == 1, 1],
    s=50, c='orange',
    marker='o', edgecolor='black',
    label='cluster 2'
)

plt.scatter(
    X[y_km == 2, 0], X[y_km == 2, 1],
    s=50, c='lightblue',
    marker='v', edgecolor='black',
    label='cluster 3'
)

# plot the centroids
plt.scatter(
    km.cluster_centers_[:, 0], km.cluster_centers_[:, 1],
    s=250, marker='*',
    c='red', edgecolor='black',
    label='centroids'
)
plt.legend(scatterpoints=1)
plt.grid()
plt.show()

在生成的散点图中，我们可以看到 k-means 算法将三个中心点放置在了每个“球体”的中心位置，考虑到这个数据集，这样的分组看起来是合理的。

手衬法（The Elbow Method）

尽管 k-means 在这个数据集上表现良好，但其中一个缺点是，在知道最优的 k 值之前，我们必须指定聚类的数量 k。在现实世界的应用中，尤其是在处理无法可视化的高维数据集时，选择聚类数量可能并不总是那么显而易见。

手肘法（Elbow Method）是一种有用的图形工具，用于估计给定任务的最优聚类数量 k。直观地说，如果 k 增加，那么聚类内的 SSE（Sum of Squared Errors，平方误差和，也常被称为“畸变”）将会减少。这是因为样本将更接近它们被分配到的中心点。然而，随着 k 的增加，SSE 减少的幅度会逐渐减小。手肘法通过绘制 SSE 关于 k 的曲线，并寻找曲线的“手肘点”（即 SSE 开始急剧减少后趋于平缓的点）来确定最优的 k 值。这个点通常被认为是 SSE 下降速率开始显著减缓的位置，因此被视为最佳聚类数量的一个合理估计。

手肘法的核心思想是识别出 k 值，在该值处畸变（即数据点与聚类中心之间的某种度量，如平方误差和）开始迅速减少。如果我们为不同的 k 值绘制畸变图，这一点将会变得更加清晰。

# 计算不同簇类的度量
distortions = []
for i in range(1, 11):
    km = KMeans(
        n_clusters=i, init='random',
        n_init=10, max_iter=300,
        tol=1e-04, random_state=0
    )
    km.fit(X)
    distortions.append(km.inertia_)

# plot
plt.plot(range(1, 11), distortions, marker='o')
plt.xlabel('Number of clusters')
plt.ylabel('Distortion')
plt.show()

从生成的图中我们可以看到，手肘位于 k = 3 的位置（在k=3处值迅速减少），这证明了 k = 3 确实是对于这个数据集的一个好选择。手肘法的这一结论与我们先前通过直接观察数据集分布或运行 k-means 算法得到的聚类结果相一致，进一步验证了选择 k = 3 的合理性。