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RSS订阅原创 重测序数据处理得到vcf文件
本文主要是记录了重测序数据处理流程：对于送往公司的DNA样品进行重测序后，得到的数据进行一系列处理得到vcf文件。补充——重测序数据处理的理论以及其它相关了解内容数据处理程序流程图！！！后续处理流程的代码仅供参考，请根据自己的实际情况自行修改！本文主要了对重测序数据进行处理得到vcf文件的流程，从得到rawdata，用fastp对数据进行质控和过滤，使用getorganelle软件对叶绿体基因组进行组装、通过构树鉴定所需个体；
2024-07-22 09:07:10
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原创 补充——重测序数据处理的理论以及其它相关了解内容
这篇博客是对重测序数据处理得到vcf文件的补充，记录了重测序数据处理的理论以及其它相关了解内容重测序专题（一）| 一文了解测序技术的发展百度百科全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序，并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。全基因组重测序的个体，通过序列比对，可以找到大量的单核苷酸多态性位点（SNP），插入缺失位点（InDel）和结构变异位点（SV）等信息.本文主要记录了重测序数据中的一些数据文件以及使用分析软件。
2024-07-22 09:06:10
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原创 科研训练课程2--论文格式修改+endnote使用
第二天2024/7/9所属目录：科研训练课程创建时间：2024/7/9作者：星云更新时间：xxx今天主要学习了如何修改论文格式，并且也对自己之前的综述进行了格式的修改；同时也补充了endnote的安装与使用。又是收获满满的一天还剩6天课程2024/7/9。
2024-07-09 23:18:18
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原创 科研训练课程1--LetPub与Web of Science（查询工具）
本系列笔记为记录大二暑期学校课程—— 科研训练与写作，记录一下每天了解了什么吧（苦逼又无聊的学习生涯又开始了。才刚结束啊）在’亲爱‘的大学想念我那远方的家的第一天（成功度过 (￣ω￣) ）所属目录：科研训练课程创建时间：2024/7/8作者：星云更新时间：xxx本文主要了解了用LetPub去查询论文所属期刊的影响因子等信息；以及用web of science 来对论文进行查询。哎，又是收获满满的一天这是第一天上课，还有整整七天，距离回家还有…2024/7/8。
2024-07-08 22:02:29
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原创 三叶青图像识别研究简概
本系列文章为近期所做项目研究而作的研究介绍。算是我近期所学的一个总结吧, 同时也希望与各位多多交流学习。星云文档github代码存储图像分类部分的研究相关代码和文档目录【1】构建图像分类数据集；主要存放图像采集与整理、可视化采集图像、划分训练集验证集、统计各类别图像数量【2】模型训练准备；主要介绍在开始训练模型前所做的一些准备，例如训练环境的搭建、安排、记录等【3】迁移学习模型；
2024-07-05 18:19:58
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原创 【8】相关补充
存放一些有关这个项目研究的补充。包括做这个项目的一些总结以及实验心得。参考我的另一篇文章阶段总结——基于深度学习的三叶青图像识别本文主要介绍了关于进行的这个项目除了步骤方法的一些补充，包括实验记录、有关SNP位点筛选、阶段总结、后续安排等，
2024-07-05 17:24:20
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原创 【4】在测试集上评估模型精度
将训练好的模型应用在测试集上，评估模型的效果本文主要介绍了在测试集上进行模型评估的代码，以及测试集图像语义特征可视化等2024/6/12。
2024-07-05 15:10:02
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原创 【2】模型训练准备
构建完图像分类数据集后，就要开始训练我们的模型了，深度学习模型训练需要大量计算资源，也就是GPU。可以在本地机器上使用GPU（如果有的话），或者在云服务上租用GPU资源。此外，还有专门为深度学习训练提供的服务，如Google的Colab和Kaggle。本文将简单介绍一下如何使用kaggle上的GPU资源。准备好了模型训练的资源，将数据上传到了kaggle平台，编写了相关代码。2024/6/12共赏金尊沈绿蚁，莫辞醉，此花不与群花比。
2024-07-05 15:02:22
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原创 【1】构建图像分类数据集
主要简述图像采集与整理、可视化采集图像、划分训练集验证集、统计各类别图像数量代码存放库本文主要介绍了如何构建我的图像分类数据集，数据集的构建是比较重要的，这里数据集图像的获取也不知道合不合格，这一步或许有点问题，考虑再完善。2024/6/12十一年前南渡客，四千里外北归人。
2024-07-05 15:01:29
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原创 【6】图像分类部署
包括将训练好的模型部署在本地终端、web端、小程序上、qt界面化。本文主要介绍了如何将pytorch模型转为ONNX模型文件以及如何将图像识别模型部署，包括部署在本地、部署在web网页、小程序、qt界面部署。2024/6/13。
2024-07-05 14:57:57
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原创 使用pyqt界面化部署
pyqt+opencv开发的图像识别qt界面目前共有五个主要界面：软件介绍界面、省份识别、浙产识别、产地识别界面、以及自定义识别页面。开发这个图像识别的qt界面，使其它学者能够轻松地测试和验证图像识别模型。另外，之后也会随着项目的完善来对这个软件进行更新。2024/6/13。
2024-07-05 14:45:36
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原创 微信小程序部署
利用uniapp+微信开发者工具+flask后端开发了三叶青图像识别微信小程序。此小程序大致分为首页、图库、识别、历史记录、我的这五个大界面。。。。2024/6/12。
2024-07-05 14:39:50
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原创 使用flask的web网页部署介绍
flask+bootstrap+jquery+mysql搭建三叶青在线识别网站，使用nginx+gunicorn将网站部署在腾讯云上，配置SSL证书。网页的界面主要包括登录界面、首页、在线识别、历史记录、个人中心、图片库以及其它界面。（如果看过我之前的博客，会发现其实这个网站的很多前端页面都是我之前自己搭建的学习网站——星云小窝 的页面，为了快速开发这个网站，我就直接拿了之前的代码并修改了一下。星云小窝项目1.0——项目介绍（一）
2024-07-05 14:34:34
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原创 【7】树莓派图像分类部署
树莓派（Raspberry Pi）是一款信用卡大小的单板计算机.百度百科介绍官网树莓派开发板安装Linux系统链接设备通过HDMI链接显示器USB键盘USB鼠标用Python编写控制代码我使用的是树莓派4B 4GB主板,组装效果如图所示（包含CSI摄像头模块、树莓派主板、USB键盘鼠标、7寸显示器）本文主要记录了我学习树莓派时的笔记，包括对树莓派的认识和组装、树莓派的运行和VNC远程连接、摄像头模块的使用、以及最后的使用yolov5来对象棋进行识别等。
2024-07-05 14:15:55
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原创 GitHub Copilot申请和使用
之前已经成功进行了Github学生认证，今天邮件通知之前的学生认证已经通过。那么就去进行GitHub Copilot申请和使用。Github学生认证成功实现GitHub Copilot申请和使用–2024/4/29。
2024-04-29 15:49:55
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原创 Github学生认证
为了免费使用GitHub Copilot，故在github中申请学生认证。在Github中进行学生认证2024/4/24。
2024-04-25 08:30:00
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原创 如何在kaggle中发布一个项目以便管理
为了使团队在kaggle中共同管理一个项目，我们可以尝试在kaggle中发布一个项目，然后邀请团队成员来共同管理项目。差不多就这些，其实我在kaggle发布一个比赛项目，主要是为了管理我的项目与团队。（其实还有一种方法，我们可以参加别人发布的竞赛，反正只要求组队管理，我们可以不管比赛，只做自己的数据集就行）。念去去，千里烟波，暮霭沉沉楚天阔–2024-4-8。
2024-04-09 15:53:43
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原创 使用labelImg标注yolov5数据集并在kaggle中使用yolov5
本文主要介绍如何使用labelImg这个软件来对yolov5数据集进行标注，生成yolo格式的文件。以及如何在kaggle中使用yolov5代码进行目标检测。介绍了使用labelImg这个软件对yolo数据集进行标注；也介绍了如何在kaggle中训练yolov5数据。古来青史谁不见，今见功名胜古人。–2024-4-2。
2024-04-02 23:20:21
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原创 关于星云小窝这个项目后续的思考（六）
若我是火，我将是那炽热的存在。燃烧着无尽的激情与渴望；在深幽的宇宙中，跳跃、热烈而自由…–2024-3-22。
2024-03-22 20:20:22
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原创 谈论一些代码实现的逻辑（四）
上一篇博客介绍了项目的目录结构，已经有了一点对项目的认识，接下来我将具体简述一些主要功能的代码实现的逻辑（原本我是想具体讲述的，然后发现太多了，于是就挑选几个来将一下实现的逻辑吧）其余更多代码实现还是直接看源码吧差不多就到这吧，其实，这个项目感觉并没有达到预期，只能说与我最开始想的样子不太一样，但是不管怎么说，也就先做到这一步了，虽然有些功能还有问题，需要完善。寂寞空庭春欲晚，梨花满地不开门–2024-3-22。
2024-03-22 19:51:15
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原创 flask项目的部署（五）
前面的众多博客，已经大致说明了项目的整体逻辑，这篇博客则主要讲述flask项目如何从开发环境到部署上线（以我个人为例）总的来说，我是使用gunicorn+nginx来部署的flask项目。–2024-3-22。
2024-03-22 18:59:50
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原创 星云小窝项目1.0——项目结构（三）
上一篇博客介绍了如何在本地启动项目，本文章则主要介绍一下该项目的主要结构，方便查看。主要介绍了这个项目的目录结构。以及补充了MVC模式的概念。曾经沧海难为水，除却巫山不是云。–2024-3-22。
2024-03-22 17:47:27
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原创 星云小窝项目1.0——项目启动（二）
上一篇博客大致介绍了星云小窝这个网站，这篇博客将介绍一下如何启动它。ok.至此项目就正常启动了，你也可以在此基础上再度创作，同时欢迎提出修改意见。天远楼台横北固，夜深灯火见扬州。–2024-3-22。
2024-03-22 16:10:44
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原创 星云小窝项目1.0——项目介绍（一）
这篇博客主要介绍一下我的一个练手的项目——星云小窝。这是一个用于学习交流的网站,网站地址：主要是以flask为后端，以bootstrap为前端框架。分为介绍页面、首页、笔记、交流、工具库、数据中心等这几个主要功能页面。支持用户使用QQ邮箱注册,同时可以进入"游客模式"，这个页面主要是对本网站的一个介绍。分为“ 首页介绍、页面轮播、星云笔记、数据中心、交流评论、工具仓库、权限设置”。PC端：大致的网站功能内容基本上就这样，这是一个练手的项目，如果有兴趣可以看看。
2024-03-22 15:54:48
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原创 生物——文献笔记
群体遗传学利用数学统计的方法研究群体中基因频率和基因型频率以及影响这些频率的因素，了解物种群体内(间) 的遗传交流情况，进而探索物种形成和物种进化的动态机制究其本质 群体遗传学研究的中心就是基 , ,因频率变化的动力学[1]。尽管群体的遗传差异和多形态特征显而易见，但定量估计遗传变异则在 世纪 年代 20 60当蛋白电泳被引入群体遗传学研究后才成为可能[4, 5]。这项技术能够检测到蛋白质的电荷变化，其应用揭示了自然界大多数群体中存在着大量遗传差异，从而促进了群体遗传学研究的发展[6]
2024-02-08 13:53:14
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原创 JQuery学习一
jQuery是一个快速，小巧，功能丰富的JavaScript库。jQuery 使HTML文档遍历和操作，事件处理和动画等操作变得更加简单。jQuery的所有功能都是通过JavaScript访问的，因此掌握JavaScript对于理解，构建和调试代码至关重要。首先，让我们看一下分别使用原生js和使用jQuery操作 HTML 的示例。el.innerHTML = "出发吧,骚年!$("#start").html("出发吧，骚年!");–2023-12-8。
2024-02-08 13:51:39
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原创 JQuery学习二
DOM(Document Object Model)仅关注浏览器所载入的文档。DOM将html文档视为由元素、属性和文本组成的一棵DOM树。整个文档是一个文档节点每个HTML标签是一个元素节点包含在HTML元素中的文本是文本节点每个HTML属性是一个属性节点注释属于注释节点HTML文档中的节点彼此间都存在关系，如一张族谱。DOM表示文档作为树结构，其中HTML元素是树中的相关节点。节点可以有子节点。同一棵树级别的节点称为兄弟姐妹。
2024-02-08 13:51:08
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原创 Ajax+JSON学习二
GET 请求一般用于信息获取，它没有请求主体，而是使用 URL 传递参数（即：传递数据给后台）。对所需发送的数据（具有名称和值）执行普通的 URL 编码，即：由一对对 “名称=值” 组成（称为：名/值对），每一对之间用 “&” 拼接，如 “name=value&name=value&…&name=value”；由于 名/值对 会附加在 URL 地址后面，因此在这串字符参数的最前面需要添加个 “?”，表示 URL 的 查询参数 开始。// GET请求的后端接口// 获取用户输入的表单数据。
2024-02-08 13:49:56
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原创 Ajax+JSON学习一
Ajax 的全称是 Asynchronous JavaScript and XML（异步的 JavaScript 和 XML），是一种用于创建动态网页的技术。Ajax 是一种使用现有标准的新方法，通过与服务器进行少量的数据交换，Ajax 可以使网页实现异步更新，这意味着可以在不重新加载整个网页的情况下，对网页的某部分进行更新。Ajax 可以提高系统性能，优化用户界面。很多框架以及代码库已将 Ajax 作为其必不可少的一个重要模块。
2024-02-08 13:48:46
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原创 Bootstrap学习三
一些插件和 CSS 组件依赖于其他插件。如果单独引用插件，请确保在文档中检查插件之间的依赖关系。jQuery 必须在所有插件之前引入页面。然而在某些情况下可能需要将此功能关闭。因此，我们还提供了关闭 data 属性 API 的方法，即解除以 data-api 为命名空间并绑定在文档上的事件。就像下面这样：如需关闭某个特定的插件，只需在 data-api 前面添加那个插件的名称作为命名空间，如下：4.1.2. 编程方式的API例如：所有的方法都可以接受一个可选的选项对象作为参数，或者一个代表特定方法
2024-02-08 13:47:22
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原创 Git学习
Git 是一个开源的分布式版本控制系统，用于敏捷高效地处理任何或小或大的项目。特点：速度简单的设计对非线性开发模式的强力支持（允许上千个并行开发的分支）完全分布式有能力高效管理类似 Linux 内核一样的超大规模项目（速度和数据量）2023–12-6。
2024-02-08 13:46:09
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原创 学习笔记——ENM模拟
学习文献里的方法，初步了解一下什么是ENM模拟文献名称：《基于MaxEnt模型和ArcGIS预测多肋藻在中国海域的适生分布特征》
2024-02-08 13:04:53
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原创 生态位模拟——草稿笔记
软件、代码、地图：链接：https://pan.baidu.com/s/1eqT7axtpTVc2I4wAwOjYvA?pwd=1wht提取码：1wht–来自百度网盘超级会员V4的分享。
2024-02-08 12:03:04
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原创 vuepress后续补充
vuepress后续补充文章目录前言一、样式修改二、首页打字机效果三、valine评论问题总结前言对自己使用vuepress的过程进行一些补充一、样式修改在public文件夹下新建一个css文件夹，用来存放修改样式文件，style.css再在config.js的头部head中引入： ['link',{rel:"stylesheet",href:"/css/style.css"}],文件内容如下：/* body { background-image: url('/i
2024-01-18 21:42:04
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原创 vuepress博客部署
前文将vuepress-reco主题个人博客搭建好之后，要将此项目部署，本文主要介绍将博客部署到github上，（因为我的gitee还未实名认证，所以也不好展示）。这篇文章主要讲述了如何将搭建好的vuepress-reco主题的博客部署到github或gitee上。–2021-1-16。
2024-01-18 00:28:21
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