linux下conda安装、换源、下载mamba

最新推荐文章于 2025-03-31 18:03:46 发布
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分类专栏： 生信基础知识 文章标签： linux conda 运维
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版权

1.下载anaconda

进官网（https://www.anaconda.com/download/success）
在这里插入图片描述
确定Linux系统

cat /etc/os-release
NAME="CentOS Linux"
VERSION="7 (Core)"
ID="centos"
ID_LIKE="rhel fedora"
VERSION_ID="7"
PRETTY_NAME="CentOS Linux 7 (Core)"
ANSI_COLOR="0;31"
CPE_NAME="cpe:/o:centos:centos:7"
HOME_URL="https://www.centos.org/"
BUG_REPORT_URL="https://bugs.centos.org/"

CENTOS_MANTISBT_PROJECT="CentOS-7"
CENTOS_MANTISBT_PROJECT_VERSION="7"
REDHAT_SUPPORT_PRODUCT="centos"
REDHAT_SUPPORT_PRODUCT_VERSION="7"

在这里插入图片描述

wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2024.06-1-Linux-x86_64.sh

sh Anaconda3-2024.02-1-Linux-x86_64.sh

2.配置环境变量

vim .bashrc
export PATH=/share/home/bgi_idbyiyr/anaconda3/bin:$PATH
source .bashrc

mamba下载

#查看 conda 镜像源，默认只有一个 - defaults
conda config --show channels
#换源
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
#查看 conda 镜像源
conda config --show channels
#安装mamba
conda install -c conda-forge -y mamba
Linux系统下Conda安装状态检查与环境管理指南
2401_85812053的博客
06-25 2072
Conda是一个跨平台的软件包管理系统，它不仅能够管理Python包，还能管理R、Ruby、Lua、Scala等其他语言的包。Conda允许用户创建隔离的环境，每个环境可以有不同的软件包和版本，从而避免不同项目之间的依赖冲突。Conda是一个跨平台的软件包管理系统，它不仅能够管理Python包，还能管理R、Ruby、Lua、Scala等其他语言的包。Conda允许用户创建隔离的环境，每个环境可以有不同的软件包和版本，从而避免不同项目之间的依赖冲突。
mamba 和conda 安装R包
xiaoyaozizai017的博客
04-28 1743
5. 安装包 6. mamba 提速 conda 6.1 安装 mamba是用于管理环境的 CLI 工具，相比于conda 对包和环境的管理，mamba可以实现并
Mamba安装和常用命令
青苔先生的博客
01-24 5050
Mamba安装和常用命令
docker容器中 bash: vi: command not found，docker apt-get 异常 Temporary failure resolving
01-06
bash: vi: command not found， 场景： 因为 docker里面没有这个命令，我们安装一下 apt-get update apt-get install vim 如果 这个时候 安装也还是会出现 异常 root@446d7cf1606c:/etc/mysql# apt-get update Err:1 http://security.debian.org/debian-security buster/updates InRelease Temporary failure resolving 'security.debian.org' Err:2 http:/
关于conda中安装mamba包的步骤
最新发布
qq_52151208的博客
03-31 443
已经安装了conda，通过conda直接安装mamba，实现下载提速。
linux查看内核版本号
I‘m Frank Lee
10-28 856
查看内核版本号 命令： uname -mrs 结果： Linux 3.10.0-957.1.3.el7.x86_64 x86_64 查看分发版本号 命令： cat /etc/os-release 结果： NAME="CentOS Linux" VERSION="7 (Core)" ID="centos" ID_LIKE="rhel fedora" VERSION_ID="7" PRETTY_...
docker中的technosoft2000/calibre-web镜像生成的容器运行apt-get，返回command not found
weixin_35754962的博客
01-10 1508
很抱歉，我不会中文。但是我可以用英文帮助你。 在 Docker 容器中运行 apt-get 命令时如果出现 "command not found" 错误，这可能是因为容器镜像没有安装 apt-get 命令所在的软件包管理工具，或者是容器没有连接到网络。 你可以尝试在启动容器时指定 --network 参数，使容器能够连接到网络，然后再尝试运行 apt-get 命令。 例如： dockerrun -...
-bash: apt-get: command not found -bash: yum: command not found
求是
09-20 1898
1. RedHat系列： Redhat、Centos、Fedora等。基于Musl libc 和 Busybox，和 Busybox 一样小巧，最小的 Docker 镜像只有 5MB；2.3. Debian系列的包管理工具是apt-get。提供 APK 包管理工具，软件的搜索、安装、删除、升级都非常方便；，使用的为apk包管理工具，安装命令为apk add xxx。# 查看系统版本，查看是否为alpine系统。由于小巧、功能完备，非常适合作为容器的基础镜像；# 查看红帽系，还是debian系。
bash: apt-get: command not found
creepbiaozi的博客
12-20 2万+
在docker里安装软件的时候报这个错误,是因为你用centos的镜像,需要用yum代替apt-get
mamba的安装及下载速度慢问题解决
静宁宇思
08-15 1720
mamba的安装及下载速度慢问题解决
Linux软件安装 conda
wangprince2017
03-14 4292
基础 conda简介 conda安装 miniconda下载官方镜像&国内镜像 下载：通常服务器在国内的选择清华或者北外，如果服务器在国外选择官网 浏览器搜索：ctrl+F wget -c, --continue resume getting a partially-downloaded file ##国内镜像地址： wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64
Conda快速安装的解决方法（Mamba安装）
TiYong的博客
03-06 1万+
如果你的Conda安装了，你可能会发现一个问题，就是使用Conda install 安装某个软件时，会特别慢，这时候呢？你会上网去搜，然后大家解决的方法呢。一是告诉你镜像可以下载快一点，二是Mamba安装可以让你更快一点。那么今天我们就来讲讲，当然，我还会告诉你，其实你可以不用装这个。
bash: apt-get: 未找到命令...
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bash: apt-get: 未找到命令...如何解决？
-bash: apt-get: command not found
阿文的博客
07-15 1万+
nfs客户端段显示命令不存在。主要是因为系统为最小化安装，一些命令没有安装导致，使用下面命令安装即可。 yum install nfs-utils.x86_64
apt-get: command not found，对于菜狗而言有可能是最低级的错误
qq_47581488的博客
08-15 812
apt-get: command not found，这个的出现有可能是因为系统的原因。1.RedHat系列：Redhat、Centos、Fedora等。2.Debian系列：Debian、Ubuntu等。Debian系列的包管理工具是apt-get。所以把apt-get换成yum试试！RedHat系列的包管理工具是yum。
docker 里面各种 command not found 总结
快乐的小三菊的博客
07-12 4719
docker 里面各种 command not found 总结。
Linux-部署DHCP服务器
weixin_46675699的博客
12-12 717
DHCP（Dynamic Host Configuration Protocol）动态主机配置协议，采用S/C模式，使用UDP67、68端口 【DHCP服务器部署】 1.为了防止vmDHCP功能的干扰，先关闭vmDHCP功能 NAT模式：有DHCP功能 仅主机模式：有DHCP功能 桥接模式：DHCP功能是由路由器实现 2.安装DHCP服务器 yum -y install DHCP 3.编辑DHCP配置文件 4.重启DHCP服务器 systemctl restart dhcp systemctl
如何用conda安装mamba
03-17
<think>好的，我现在需要回答用户关于如何通过conda安装mamba的问题。用户还提供了三个引用，我需要仔细查看这些引用，确保回答准确并正确引用相关信息。 首先，我应该回忆conda和mamba的关系。Mamba是一个更快的替代品，用于管理conda环境中的包。根据引用[2]，用户提到现在可以直接安装mamba而无需先安装conda，这可能指的是使用其他方法，比如直接下载mamba的独立版本？不过通常情况下，mamba最初是作为conda的替代客户端，需要通过conda来安装。可能用户提到的“直接舍弃conda”是指安装Mambaforge这样的发行版，它自带了mamba而无需先安装conda。不过用户的问题明确是“通过conda安装mamba”，所以需要明确步骤。 引用[1]说明安装完成后，只需要将conda命令替换为mamba即可，这意味着用户可能已经有一个conda环境，然后安装mamba作为其增强工具。正确的步骤应该是通过conda来安装mamba。例如，使用conda install命令。 接下来，我需要检查引用中的信息。引用[2]提到在Ubuntu安装conda和mamba，并指出之前是先装conda再装mamba，但现在可以直接舍弃conda。这可能是指用户现在可以安装Mambaforge，它内置了mamba而无需先安装conda。但用户的问题是如何通过conda安装mamba，所以可能需要两种情况：一种是用户已有conda，然后安装mamba；另一种是直接安装Mambaforge。不过根据问题描述，用户明确询问的是通过conda安装mamba，因此重点应放在第一种情况。 根据常规方法，安装mamba的正确步骤是使用conda的conda-forge频道进行安装。例如，运行命令： conda install -n base -c conda-forge mamba 这会将mamba安装到base环境中，之后就可以用mamba代替conda命令了。这和引用[1]中的描述一致，即替换命令即可。 此外，引用[3]提到在conda环境中使用mamba来配置QIIME 2，这说明在已有的conda环境中安装mamba是可行的，并且是推荐的做法，以提升安装速度。 因此，正确的步骤应该是： 1. 确保conda已经正确安装。 2. 在终端中运行安装mamba的命令，指定conda-forge频道。 3. 验证安装是否成功，之后就可以使用mamba命令代替conda。 同时，可能需要提醒用户，如果尚未安装conda，也可以选择直接安装Mambaforge，这样就不需要先安装conda。但根据用户的问题，他们可能已经安装了conda，所以需要给出通过conda安装的方法。 需要确保命令正确无误，语法正确，避免用户操作错误。例如，正确的命令是： conda install -n base -c conda-forge mamba 这里，-n base指定了安装到base环境，-c conda-forge指定了频道。这是标准的安装方式。 最后，生成相关问题需要考虑用户可能的后续疑问，比如安装后的使用，性能比较，常见问题等。</think>### 通过 conda 安装 mamba 的方法 1. **前提条件** 确保已安装 Conda（Anaconda 或 Miniconda）。可通过命令 `conda --version` 验证是否安装成功。 2. **添加 conda-forge 频道**（推荐） 运行以下命令，确保 conda-forge 频道已启用： ```bash conda config --add channels conda-forge ``` 3. **安装 mamba** 在终端中执行以下命令，将 mamba 安装到 Conda 的 `base` 环境： ```bash conda install -n base -c conda-forge mamba ``` 安装完成后，即可使用 `mamba` 代替 `conda` 命令（例如 `mamba install`、`mamba update`），提升包管理速度[^1]。 4. **验证安装** 运行 `mamba --version`，若输出版本号（如 `mamba 1.5.3`），则安装成功。 --- ### 其他安装方式（无需 Conda） 若尚未安装 Conda，可直接下载 **Mambaforge**（集成 Mamba 和 Conda 功能的发行版）： 1. 访问 [Mambaforge 官网](https://github.com/conda-forge/miniforge#mambaforge) 下载对应系统的安装脚本。 2. 运行安装脚本，例如 Linux/macOS： ```bash bash Mambaforge-Linux-x86_64.sh ``` 安装后，默认使用 `mamba` 命令[^2]。 --- ### 注意事项 - 使用 `mamba` 时，命令语法与 `conda` 完全一致，例如创建环境： ```bash mamba create -n myenv python=3.9 ``` - 在已有 Conda 环境中，`mamba` 可加速依赖解析和包下载[^3]。 ---
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