错误场景
在进行TCGA-GBM数据下载时候,发生了锁竞争?
错误如下:
Error in unpackPkgZip(foundpkgs[okp, 2L], foundpkgs[okp, 1L], lib, libs_only, :
ERROR: failed to lock directory ‘D:\Programme\R\R-3.6.1\library’ for modifying
Try removing ‘D:\Programme\R\R-3.6.1\library/00LOCK’
unlink(“D:/Programme/R/R-3.6.1/library/00LOCK”, recursive = TRUE)
解决方案
原理是发生锁竞争错误了。
了解到R可以通过unlink的方式,来关闭这个链接,释放这个lock文件,重新执行就没问题啦。
unlink("D:/Programme/R/R-3.6.1/library/00LOCK", recursive = TRUE)
其中对应的地址要按照实际情况(这里只是我本地环境)
LOCK地址
如果不知道library的路径在哪里,可以看RStudio的Tools-Global Option-General- R version,举例如下。