富集相关
compareCluster
clusterProfiler 包中
- 富集条目可以挑选重复的问题
- 富集条目不一致的问题
- 文字溢出问题
- 网格图绘图错误的问题
- 网格图使用genesymb绘制的问题
- 自动换行的问题
一些R function 的问题
重铸的问题
- reshape2::melt
- tidyr::pivot_longer(cols = -id, names_to = “variable”, values_to = “value”)
其中,cols参数指定要转换的列,names_to参数指定新列的名称,values_to参数指定新值的名称。
切片的问题
- split()
dplyr 相关问题
- any_of
- all_of
stats::aggregate()
Splits the data into subsets, computes summary statistics for each, and returns the result in a convenient form.
Usage
aggregate(x, …)
Default S3 method:
aggregate(x, …)
S3 method for class ‘data.frame’
aggregate(x, by, FUN, …, simplify = TRUE, drop = TRUE)
S3 method for class ‘formula’
aggregate(formula, data, FUN, …,
subset, na.action = na.omit)
S3 method for class ‘ts’
aggregate(x, nfrequency = 1, FUN = sum, ndeltat = 1,
ts.eps = getOption(“ts.eps”), …)