1. hhfilter:
过滤MSA信息的,可将序列相似度(-id 90)、gap过多(-cov 80)从MSA中移除。
2. hmmsearch
将hmm文件(隐马尔可夫模型)搜索FASTA文件
3. hmmbuild
可将MSA生存hmm文件(隐马尔可夫模型)
1. hhfilter:
过滤MSA信息的,可将序列相似度(-id 90)、gap过多(-cov 80)从MSA中移除。
2. hmmsearch
将hmm文件(隐马尔可夫模型)搜索FASTA文件
3. hmmbuild
可将MSA生存hmm文件(隐马尔可夫模型)