模拟计算 | 如何在POSCAR中固定原子坐标?看看大神怎么做的吧！

Q：老师，怎么在POSCAR中固定原子坐标？

A：固定POSCAR中的原子坐标，当然首推vaspkit了，其中的402可以选择按高度来固定原子坐标，轻松加愉快！

Q：老师，但是如果我做的是掺杂体系，我只想固定其中部分原子怎么办啊，难道是一个一个原子筛选？

A：

今天，小编就来帮大家解决这个问题，而且是舒舒服服的解决掉

相信现在很多小伙伴还是使用Materials Studio来建模，然后导出.cif文件，再用VESTA转化为.vasp文件。

所以，在这种情况下，我们即使用MS的Visualizer Tools > Constraints固定过原子坐标了，但是导出到VESTA后并不会保留这些固定原子的信息，很难受啊！

不过，小编今天给大家分享一个脚本，快跟着小编一起来学习一下怎么使用吧。

这个脚本是武汉理工大学赵焱课题组使用Perl语言编写的，可以将Material Studio中建立的后缀名为.xsd的文件直接转换为可供VASP使用的POSCAR，使用起来非常方便，给赵老师点赞。

下面小编以AuAg合金固定所有的Au原子为例给大家做一个示范：

01构建AuAg合金的模型

首先打开MS，构建AuAg合金的模型，（黄色的是Au，蓝色的Ag，是比例是小编随便设置的）

02固定Au原子坐标

选中所有的Au原子，然后点击Modify > Constraints > Fix fractional position

03生成POSCAR文件

把下载好的脚本xsd2pos.pl拖入目标文件所在的目录，修改第12行的文件名，然后点击Debug按钮即可在生成POSCAR文件，导出文件就可以了。（注意生成的是.txt文件，导出后直接改一下文件格式就可以了）

04检查导出POSCAR文件

检查并导出的POSCAR文件，就可以发现我们选中的原子已经被固定了。

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