MacOS下载FSL参考指南

1、下载安装文件：

Google 搜索FlS download
https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads_registration/
注册后下载获取软件安装文件

2、运行安装文件

在终端中运行 fslinstaller.py
在这里默认大家的电脑已经安装好了python3.
可以使用

python3 --version

查询自己的python版本。
如果python的版本过高，会导致fsl安装不成功。
这里提供一个解决办法，可以下载anaconda并创建一个python2的虚拟环境。
以我的电脑举例

conda create -n myenv python=2.7

这时候可以再次输入命令：

python fslinstaller.py

接下来可以在终端中输入fsl打开fsl软件的窗口。

3、可能会遇到的报错

当作业进行到需要用reg命令的时候，可能会发生以下报错：

这时候需要安装NiftyReg，可以自行下载NiftyReg文件进行安装。
这里我使用的是anacond安装的办法

conda install -c conda-forge niftyreg

#查询 reg_aladin版本检查安装是否成功
which reg_aladin

（一行一行输入）

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