Ubuntu下搭建R语言开发环境

本文详细介绍了如何在Ubuntu操作系统中搭建R语言开发环境,包括修改sources.list文件以添加R项目源,更新软件源,安装R基础版和开发版,解决rJava加载错误以及配置Java环境变量。遵循步骤操作,即可成功在Ubuntu上使用R语言。

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(1)修改sources.list源文件

用文本编辑软件如 vim 或 gedit 或 kate 打开 /etc/apt/sources.list 文件,在文本末尾新增一行:

1)如果是ubuntu是16.04 LTS,新增

deb https://cloud.r-project.org//bin/linux/ubuntu xenial/

2)如果是ubuntu是15.10,新增

deb https://cloud.r-project.org//bin/linux/ubuntu wily/

3)如果ubuntu是14.04 LTS,新增

deb https://cloud.r-project.org//bin/linux/ubuntu trusty/

4)如果ubuntu是12.04 LTS,新增

deb https://cloud.r-project.org//bin/linux/ubuntu precise/

将相应的软件源添加到source的最后一行

(2)、运行更新
$ sudo apt-get update
更新源,出现如图所示未通过签名验证等问题,R源更新失败。
更新失败

CRAN中存储的Ubuntu包需要通过密钥E084DAB9进行签名验证,运行以下命令添加密钥到ubuntu系统

$ sudo apt-key adv –keyserver keyserver.ubuntu.com –recv-keys E084DAB9

结束后,如下图所示设置成功。

设置签名验证

设置成功

### 安装和配置 R 和 RStudio Server #### 准备工作 为了确保顺利安装,在开始之前应更新系统的软件包列表并升级已有的软件包到最新版本。 ```bash sudo apt update && sudo apt upgrade -y ``` #### 安装必要的依赖库 一些额外的开发库对于R及其扩展包的支持非常重要。这些可以通过下面命令来安装: ```bash sudo apt-get install libgsl-dev liblapack-dev liblas ``` 这一步骤可以提供给R更多的功能支持以及更好的性能表现[^5]。 #### 安装 R 语言环境 通过官方CRAN仓库获取最新的稳定版R,首先添加GPG密钥和源地址至APT源列表中: ```bash wget https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/marutter_pubkey.asc sudo mv marutter_pubkey.asc /etc/apt/trusted.gpg.d/ echo "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu $(lsb_release -cs)-cran40/" | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/cran.list ``` 接着再次刷新软件包索引,并执行R本身的安装过程: ```bash sudo apt update sudo apt install r-base ``` 此时已经成功设置了基础的R运行环境[^1]。 #### 下载与安装 RStudio Server 前往[RStudio官方网站](https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/)定位适用于Ubuntu 22.04 LTS架构下的.deb文件(例如`rstudio-2022.07.2-576-amd64.deb`)。可以直接在浏览器里操作完成下载动作;或者利用命令行工具如`curl`或`wget`实现自动化流程: ```bash cd ~ wget https://download1.rstudio.org/desktop/bionic/amd64/rstudio-2022.07.2-576-amd64.deb sudo dpkg -i rstudio-*.deb ``` 如果遇到任何由于未满足依赖关系而导致的问题,则可尝试修复方案: ```bash sudo apt --fix-broken install ``` 上述指令能够帮助处理可能存在的残缺安装情况[^3]。 #### 启动服务及访问验证 一旦安装完毕,默认情况下RStudio Server会自动启动。可以通过以下方式确认其状态和服务端口监听状况: ```bash systemctl status rstudio-server.service netstat -tulnp | grep rstudio ``` 最后,打开Web浏览器输入服务器IP地址加上指定端口号(通常是8787),即可以看到登录界面[^4]。
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