TDDFT计算软件Octopus学习笔记(七): 二维材料计算(WS2)

我们之前提到的例子如Silion,Diamond, ZnO等都涉及到块状(bulk)材料的计算,通过使用周期性边界条件及相应命令来实现。

PeriodicDimensions = 3

本章我们将进行二维材料的计算,以二硫化钨(WS2)为例。 即在x,y方向上仍然使用周期性边界条件,但是在z方向上取消这一条件,这样所计算的就是二维单层结构,只要改变命令如下即可。

PeriodicDimensions = 2

总体的基态计算输入文件 inp 为:

CalculationMode = gs
FromScratch = yes
PeriodicDimensions = 2   # x,y
ParKPoints = auto
BoxShape = parallelepiped
ExperimentalFeatures=yes
PseudopotentialSet = pseudodojo_pbe

s = 0.24
%Spacing      # 单位 Bohr
 s | s | s
%

%LatticeVectors
  1.0 | 0.0   | 0.0
 -0.5 | sqrt(3)/2 | 0.0
  0.0 | 0.0   | 1.0
%

a = 3.186*angstrom
b = 18.146*angstrom
%LatticeParameters
 a | a | b
%

%ReducedCoordinates
 "W"  | 0    | 0    | 0
 "S"  | 2/3  | 1/3  |-0.086675
 "S"  | 2/3  | 1/3  | 0.086675
%

k = 16
%KPointsGrid
  k  |  k  |  1
%

KPointsUseSymmeitries = yes

相应晶格参数可以取自 二维材料数据库 C2DB, 或者Material project。这里需要注意,因为我们想计算的二维单层,所以在Z方向的晶格参数上有所调整,我们将其调整为一个很大的值,这里设为18.146Angstrom, 这样波函数有足够的空间衰减到0, 从而规避单层材料与外界的复杂相互作用。 而且,如果Z方向晶格参数很大,相应的倒格矢就很小,所以在Z方向进行K点抽样时,我们只需要抽1个点就够了。

基态计算完成后,我们进行非占据态计算以求得能带结构。

CalculationMode = unocc
FromScratch = yes
PeriodicDimensions = 2   # x,y
ParKPoints = auto
BoxShape = parallelepiped
ExperimentalFeatures=yes
PseudopotentialSet = pseudodojo_pbe

s = 0.24
%Spacing                 # 单位 Bohr
 s | s | s
%

%LatticeVectors
  1.0 | 0.0   | 0.0
 -0.5 | sqrt(3)/2 | 0.0
  0.0 | 0.0   | 1.0
%

a = 3.186*angstrom
b = 18.146*angstrom
%LatticeParameters
 a | a | b
%

%ReducedCoordinates
 "W"  | 0    | 0    | 0
 "S"  | 2/3  | 1/3  |-0.086675
 "S"  | 2/3  | 1/3  | 0.086675
%

%KPointsPath
  18 | 10 | 20
 0.0 | 0.0 | 0.0  # gamma
 0.5 | 0.0 | 0.0  # M
 1/3 | 1/3 | 0.0  # K
 0.0 | 0.0 | 0.0  # Gamma
%

KPointsUseSymmetries = no

ExtraStates = 8
ExtraStatesToConverge = 6
Output = dos

这里输出 Output = dos 是为了顺带输出 费米能, 在画能带图的时候, 可以减去费米能使价带最高点移到0点,便于读图。​​​​​​​

所得能带图如下, 使用PBE泛函得到的带隙是1.82eV, 与实验值2eV左右已经很接近了。

 

 

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