医学影像组学特征值（Radiomics Features）提取

最新推荐文章于 2024-08-08 08:14:23 发布
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分类专栏： 医学图像处理 医学影像组学
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在AI+医学影像方向工作近三年，主要负责医学标注工具和影像组学（Radiomics）特征值提取软件的实现。

基于这些工具软件发表了5篇高分（IF>5）文章,下面逐一做个总结和整合，以更好地开展工作。

1.医学标注工具软件

   3D Slicer是一款非常成熟的医学影像处理平台软件，它集成了非常多实用的工具，我们一般使用segmentation editor做为添加ROI的方法，并将该ROI导出后，用于后续影像组学的计算。

2.radiomics 计算

对于上面第一步勾画的ROI，可以使用pyradiomics进行特征值提取计算。具体实现，后文会介绍。

总结：目前计算影像组学的步骤如下：

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pyradiomics使用——1. 医学影像的组学特征值（Radiomics Features）提取
啷个哩个啷
05-30 5659
文章目录1. 使用插件1.1 插件安装1.2 插件使用2. 使用python代码2.1 安装2.2 使用2.2.1 官方示例2.2.2 快速使用2.2.3 其它使用3. 组学特征字段意义说明 Github地址：https://github.com/AIM-Harvard/pyradiomics 官方文档地址：https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/features.html 1. 使用插件 从pyradiomics的Github仓库中可以知道，pyradio
python-pyradiomics-影像组学提取特征-代码
xxx
07-30 1104
【代码】python-pyradiomics-影像组学提取特征-代码。
影像组学工具包
01-29
影像组学是医学影像处理领域针对实体肿瘤分析提出的新的方法，科研正热，看标题自然清楚，影像组学工具包Radiomics
PyRadiomics：基于Python的医疗影像 Radiomics 分析工具
最新发布
gitblog_00439的博客
08-08 942
PyRadiomics：基于Python的医疗影像 Radiomics 分析工具 pyradiomics项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/py/pyradiomics 项目介绍 PyRadiomics 是一个开源的 Python 库，专门用于从医学影像中提取 Radiomics 特征。该库旨在建立放射组学分析的参考标准，并提供一个经过测试和维护的开放平台，以...
影像组学特征提取软件IBEX
03-24
影像组学特征提取软件IBEX，包含了许多 分析模块，如图像导入、勾画、预处理和特 征提取。包含了一阶、二阶和高阶的特征提取算法， 已成功应用于不同模态影像的特征提取，涵盖了CT、 PET和MRI，涉及肺癌、食管癌、头颈癌和脑转移瘤 等
使用pyradiomics提取影像组学特征【详细】
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weixin_46428351的博客
03-19 4万+
使用pyradiomics提取影像组学特征 最近由于项目需求要使用pyradiomics提取影像组学特征，网上阅读了很多别人的博客，学到一些，然后去查看了pyradiomics的官方文档，最后自己实现了特征的提取，写下此文记录，方便日后查看。 首先放上官方文档：https://pyradiomics.readthedocs.io/ 和pyradiomics源代码地址：https://github.com/AIM-Harvard/pyradiomics 第一步、安装 在已经安装好的Python环境下，执行：
图像特征提取_影像组学特征提取——知行合一（工具篇）
weixin_39897687的博客
12-18 8274
在上一篇"理论篇"中，咱们一起讨论了保证影像组学特征提取的可重复一致性，所需要具备的各项理论知识，包括实现过程中需要注意的重要细节和避免的错误。但大家心中是否始终存有一个疑问：理论我是清楚了，但真的要我自己动手去编程实现吗？我的目标是完成毕业论文或者发表学术论文，特征提取只是其中一步，真的没时间(没实力)去实现这一大套啊。重复造轮子的事情当然不能干。不用担心，Radiomics的大神们也...
影像组学|特征定义以及提取
xiaoheijiayoubbs的博客
01-25 9290
特征定义以及提取
医学图像的特征提取
fanfangyu的博客
12-03 1万+
1.医学图像处理的基本流程：图像预处理、特征提取、分类。其算法的设计关键为特征提取和分类两部分。 2.疾病的诊断取决于对医学图像的获取和医学图像的解释。 3.主要研究工作为利用图像处理技术，通过形状、颜色、纹理以及与周围组织的关系等数据信息的处理，来对图像进行准确的分析，以此区别出正常和异常的医学图像 4.研究目的及意义：不同模式的图像信息因其成像原理不同具有各自的特点，存在对比度和分辨率的
3D Slicer 5.0.2 安装包（用于影像组学特征提取等）
06-13
开源医学影像分析和可视化平台。 从功能层面，它提供非常丰富的交互和可视化界面，你可以用它导入医学影像，然后进行影像的分割、重建、配准、标记点选择、测量等等操作。它本身提供了非常多的模块，比如优秀的配准...
Slicer安装包（用于放射组学特征提取等）
09-29
Slicer是一款常用于MR等临床数据分析的工具，可以在内部配置python程序，如常用于放射组学提取特征的pyradiomics。
radiomics图像特征计算程序（46）
04-02
可以计算除去针对肿瘤特征之外的图像初始特征，总共46个特征
python影像组学_【影像组学预测模型-Radiomics】实操教学
weixin_42511396的博客
02-10 7902
影像组学(Radiomics)是一个新兴的概念,2012 年由荷兰学者 Philippe Lambin 首次提出,其定义是借助计算机软件,从医学影像图像中挖掘海量的定量影像特征,使用统计学和/或机器学习的方法, 筛选最有价值的影像组学特征,用以解析临床信息,用于疾病的定性、肿瘤分级分期、疗效评估和预后预测等.流程概述第一步：勾画ROI(三维ROI)这一步很多软件都能做到 (工具见第二部分)。请留意...
平台更新：影像组学特征提取分析一步到位，知识点搭配视频讲解
weixin_43750722的博客
04-01 871
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医学影像特征提取与导出
更上一层楼！
08-20 1424
本文对医学影像及感兴趣区进行了简要解读，并围绕如何提取医学影像特征及导出做了详细示例，为后续数据预处理及建模打下了坚实的数据基础。
【影像组学】用3Dslicer或Python提取影像组学特征
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radiomics.featureextractor-----使用pyradiomics提取2维医学图像及其掩模的特征
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11-04 7034
1 本篇解决的问题介绍 一般而言都是使用SimpleITK.ReadImage()方法来读取3D的医学图像和掩模，然后再利用pyradiomics中featureextractor来直接提取一阶特征、3D形状特征、小波分解特征等。问题出现了，并不是所有的3D医学图像都是有其对应的3D Mask的，这是因为有些比较细小的3D病变组织可能极其难以手动分割或者自动分割。这导致数据集转化成了这些3D图像的某些侧面的截面图以及对应的2D Mask. （注！这些2D的截面只能保存成为普通的JPG、BMP图像了） 于是：
影像组学特征值自动提取及统计软件需求分析
Coder_LCB的博客
10-27 641
Hi There, 由于接收到很多朋友的私信，基本都是需要提取特征值并统计。 因为有这个需求，计划开发这样一个软件，如果可能，请大家留下自己的具体期望：需要什么样的功能？谢谢。 ...
python影像组学特征提取
11-23
影像组学是一种利用医学影像数据进行定量分析的方法，可以帮助医生更好地诊断和治疗疾病。而影像组学特征提取则是影像组学的核心步骤之一，它可以从医学影像中提取出各种特征，如形态学、纹理、灰度等特征，用于后续的分析和建模。 以下是使用Python进行影像组学特征提取的步骤： 1.安装pyradiomics库 在已经安装好的Python环境下，执行以下命令即可安装pyradiomics库： ```shell pip install pyradiomics ``` 2.导入必要的库和模块 ```python import SimpleITK as sitk from radiomics import featureextractor ``` 3.读取医学影像数据 ```python image = sitk.ReadImage('path/to/image') mask = sitk.ReadImage('path/to/mask') ``` 4.创建特征提取器 ```python extractor = featureextractor.RadiomicsFeatureExtractor() ``` 5.设置特征提取器参数 ```python extractor.disableAllFeatures() # 禁用所有特征 extractor.enableFeatureClassByName('firstorder') # 启用指定类别的特征 extractor.enableFeatureByName('original_firstorder_10Percentile') # 启用指定特征 ``` 6.执行特征提取 ```python featureVector = extractor.execute(image, mask) ``` 其中，特征提取器的参数可以根据具体需求进行设置，如启用不同的特征类别、特征选择等。
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