在上一篇"理论篇"中,咱们一起讨论了保证影像组学特征提取的可重复一致性,所需要具备的各项理论知识,包括实现过程中需要注意的重要细节和避免的错误。但大家心中是否始终存有一个疑问:理论我是清楚了,但真的要我自己动手去编程实现吗?我的目标是完成毕业论文或者发表学术论文,特征提取只是其中一步,真的没时间(没实力)去实现这一大套啊。
重复造轮子的事情当然不能干。不用担心,Radiomics的大神们也早已想到了这一点。光说不练假把式,连说带练才是真把式。大咖们虽然没听说过王阳明,也不懂心学,但对“知行合一”的追求,却是共通和共同的。
PyRadiomics
废话铺垫这里,必须引出工具篇的主角,PyRadiomics工具箱了。这是Radiomics网站团队开发和推出的一个开源Python工具包。
Github:https://github.com/Radiomics/pyradiomics
文档网站:https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/
官方参考文献:Griethuysen J J M V , Fedorov A , Parmar C , et al. Computational Radiomics System to Decode the Radiographic Phenotype[J]. Cancer Research, 2017, 77(21):e104-e107. https://cancerres.aacrjournals.org/c