平台更新：影像组学特征提取分析一步到位，知识点搭配视频讲解

最新推荐文章于 2024-08-16 10:29:36 发布
最新推荐文章于 2024-08-16 10:29:36 发布
阅读量872 收藏 15
点赞数
分类专栏： 人工智能 医学影像 影像组学 文章标签： 人工智能 深度学习 数据挖掘 机器学习
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_43750722/article/details/123889532
版权
本文介绍了如何进行数据预处理，包括整理数据并使用'onekey_comp'工具进行影像组学任务。该工具支持'comp'（影像组学任务）、'survival'（生存分析）和'What/Which'（深度学习任务）。在使用过程中，可能遇到No module named XXX错误，解决方法是激活Anaconda环境并安装缺少的模块。长时间运行Jupyter可能导致需要重新运行所有单元格。
摘要由CSDN通过智能技术生成

数据预处理

1、整理好数据，生成对应的文件夹

2、打开桌面的“ onekey_comp”选择不同的组件打开，

      “comp”代表不同的影像组学任务

      “survaval”代表生存分析，回归等任务

      “What/Which”代表深度学习任务

3、需要改的三个地方

最低0.47元/天 解锁文章
影像组学工作站
关注
专栏目录
图像特征提取_影像组学特征提取——知行合一（工具篇）
weixin_39897687的博客
12-18 8276
在上一篇"理论篇"中，咱们一起讨论了保证影像组学特征提取的可重复一致性，所需要具备的各项理论知识，包括实现过程中需要注意的重要细节和避免的错误。但大家心中是否始终存有一个疑问：理论我是清楚了，但真的要我自己动手去编程实现吗？我的目标是完成毕业论文或者发表学术论文，特征提取只是其中一步，真的没时间(没实力)去实现这一大套啊。重复造轮子的事情当然不能干。不用担心，Radiomics的大神们也...
影像组学特征提取软件IBEX
03-24
影像组学特征提取软件IBEX，包含了许多 分析模块，如图像导入、勾画、预处理和特 征提取。包含了一阶、二阶和高阶的特征提取算法， 已成功应用于不同模态影像的特征提取，涵盖了CT、 PET和MRI，涉及肺癌、食管癌、头颈癌和脑转移瘤 等
传统组学之Onekey平台记录
最新发布
LeviLizhi的博客
08-16 199
相关学习公众号：影像组学工具
【影像组学pyradiomics教程】（三）自定义特征提取
JianJuly的博客
05-07 2万+
本系列博客后续将更新于个人微信公众号，欢迎关注。 3.1 Types of Customization 个性化特征抽取的方法有三种： 指定哪种图像类别（原始图像/衍生图像）用于提取特征； 指定抽取哪种特征（特征类别）； 指定设置。设置可以用于进行预处理，定制特定的滤波器（对图像进行滤波）和特征类别 提示： 在对特征提取器和某个特征类别进行初始化的时候，我们可以使用关键字...
影像组学|特征定义以及提取
xiaoheijiayoubbs的博客
01-25 9317
特征定义以及提取
使用pyradiomics提取影像组学特征【详细】
热门推荐
weixin_46428351的博客
03-19 4万+
使用pyradiomics提取影像组学特征 最近由于项目需求要使用pyradiomics提取影像组学特征，网上阅读了很多别人的博客，学到一些，然后去查看了pyradiomics的官方文档，最后自己实现了特征的提取，写下此文记录，方便日后查看。 首先放上官方文档：https://pyradiomics.readthedocs.io/ 和pyradiomics源代码地址：https://github.com/AIM-Harvard/pyradiomics 第一步、安装 在已经安装好的Python环境下，执行：
python影像组学_【影像组学预测模型-Radiomics】实操教学
weixin_42511396的博客
02-10 7914
影像组学(Radiomics)是一个新兴的概念,2012 年由荷兰学者 Philippe Lambin 首次提出,其定义是借助计算机软件,从医学影像图像中挖掘海量的定量影像特征,使用统计学和/或机器学习的方法, 筛选最有价值的影像组学特征,用以解析临床信息,用于疾病的定性、肿瘤分级分期、疗效评估和预后预测等.流程概述第一步：勾画ROI(三维ROI)这一步很多软件都能做到 (工具见第二部分)。请留意...
《五笔”学习一步到位》作者: 导向科技编著 出版年: 2004年
12-23
《“五笔”学习一步到位》语言简洁、图文并茂、以图析文、直观生动，使读者既能理解五笔字型的输入原理，又能快速记忆拆字原则、字根分布等规律，让枯燥的记忆变得生动而愉快，打破学习五笔“难记”的瓶颈。...
北师大版三年级上册数学期末复习（全册知识点汇总）.docx
10-20
北师大版三年级上册数学期末复习的知识点涵盖了多个单元，包括混合运算、观察物体、加与减、里程表问题、乘与除以及周长。这些知识点是三年级数学学习的重点，下面将逐一详解。 首先，混合运算是基础的数学概念，...
基于SIFT特征的图像特征提取
weixin_43821447的博客
06-19 1750
图像检索原理概述 首先，我们要明白，图像检索，简单的说，便是从图片检索数据库中检索出满足条件的图片，图像检索技术的研究根据描述图像内容方式的不同可以分为两类： 一类是基于文本的图像检索技术，简称TBIR， 一类为基于内容的图像检索技术，简称CBIR。 两类图像检索技术 基于文本的图像检索(TBIR)技术，其主要原理为利用文本描述，如文本描述图片的内容、作者等等的方式来检索图片； 基于图像的内容语义的图像检索技术（CBIR），利用图片的颜色、纹理及图片包含的物体、类别等信息检索图片，如给定检索目标图片，在图像
Slicer安装包（用于放射组学特征提取等）
09-29
Slicer是一款常用于MR等临床数据分析的工具，可以在内部配置python程序，如常用于放射组学提取特征的pyradiomics。
医学影像组学特征值（Radiomics Features）提取
Coder_LCB的博客
05-22 2万+
在AI+医学影像方向工作近三年，主要负责医学标注工具和影像组学（Radiomics）特征值提取软件的实现。 基于这些工具软件发表了5篇高分（IF>5）文章,下面逐一做个总结和整合，以更好地开展工作。 1.医学标注工具软件 3D Slicer是一款非常成熟的医学影像处理平台软件，它集成了非常多实用的工具，我们一般使用segmentation editor做为添加ROI的方法，并将该...
基于pyradiomics影像组学特征提取
Alexa_的博客
01-14 4005
在这里，我们使用pyradiomics来提取影像组学特征。首先，我们先介绍pyradiomica工具包，然后我们进行特征的提取。PyRadiomics的官方文档:https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/ 1.1.2,设置特征提取器，获得想要特征： 通过自定义特征提取器，可以根据自己的需求来设置并提取特征。 其实，需要设置两个方面：1，图像类型；2，所要提取的特征；3，提取器设置第一步：图像类型：首先，设置提取特征的图像类型，可以指定用于提取特征的图像类型。
影像组学特征提取 — 原始图像为dicom格式，mask图像为nrrd格式
Sweety_Lin的博客
11-23 4070
原始图像为dicom格式，mask图像为nrrd格式，单个subject影像组学特征提取
【影像组学】用3Dslicer或Python提取影像组学特征
abdslfwoeugp
06-15 1万+
用3Dslicer或Python提取影像组学特征
影像组学特征值自动提取及统计软件需求分析
Coder_LCB的博客
10-27 641
Hi There, 由于接收到很多朋友的私信，基本都是需要提取特征值并统计。 因为有这个需求，计划开发这样一个软件，如果可能，请大家留下自己的具体期望：需要什么样的功能？谢谢。 ...
Pyradiomics 影像组学 手动特征提取
m0_74838875的博客
05-09 2415
我使用的是绝对路径，注意路径中不要出现中文,注意转义字符“/”，原来的路径在这个文件夹里面读取数据。
灰度共生矩阵特征提取步骤_影像组学特征提取——知行合一（实践篇）
weixin_39908462的博客
12-18 1822
上学的时候，老师讲了原理和定理之后，都会再讲一道例题，带着大家把刚学的知识上手用一遍，来加深和巩固理解。Radiomics的大咖们也是如此，诲人不倦，先讲原理，再给工具，然后还要再做一个示例，带领大家走一个完整的影像组学分析流程。在工具篇提到的PyRadiomics官方参考文献中，大咖们不仅介绍了PyRadiomics，而且还给出了一个Case Study，介绍他们是如何使用PyRadi...
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值