python实现医学病理图片(SVS格式)的格式转换

最新推荐文章于 2024-05-10 09:49:52 发布

ericohe

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分类专栏： Python

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代码

# svs_split.py
import pyvips
import sys
 
filepath = sys.argv[1]  
img = pyvips.Image.new_from_file(filepath, access='sequential')

series = filepath[0:len(filepath) -3]
img.dzsave(series)

python svs_split.py test.svs

执行以上代码后，会生成两份文件，分别是：test.dzi，test_files，前者是单个文件，后者是一个文件夹

注意：

需要下载vips库，解压到同一级目录

https://github.com/libvips/libvips/releases

https://github.com/libvips/libvips/releases/download/v8.10.5/vips-8.10.5.tar.gz

web查看工具

https://openseadragon.github.io/#download

 
<!DOCTYPE html>
<html lang='en'>
 
<head>
    <meta charset='UTF-8'>
    <title>OpenSeadragon_Demo0</title>
    <script src='../openseadragon.min.js'></script>
</head>
 
<body>
    <div id='openSeadragon1' style='width:1850px; height:960px;'></div>
</body>
 
 
<script type='text/javascript'>
    OpenSeadragon({
        id: 'openSeadragon1',
        prefixUrl: '../images/',
        tileSources: {
            Image: {
                xmlns: 'http://schemas.microsoft.com/deepzoom/2008',
                Url: './test_files/',
                Overlap: '1',
                TileSize: '254',
                Format: 'jpeg',
                Size: {
                    Height: '32893',
                    Width: '46000'
                }
            }
        }
    });
</script>
 
</html>

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python实现医学病理图片(SVS格式)的格式转换

# svs_split.pyimport pyvipsimport sys filepath = sys.argv[1] img = pyvips.Image.new_from_file(filepath, access='sequential')series = filepath[0:len(filepath) -3]img.dzsave(series)pythonsvs_split.py test.svs执行以上代码后，会生成两份文件，分别是：test.dzi，tes...
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