mhd、raw文件调节窗位与窗宽

最新推荐文章于 2024-06-20 11:08:30 发布
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分类专栏： 图像处理 CV 文章标签： python 图像处理
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本文链接：https://blog.csdn.net/Friedrichor/article/details/125283021
版权 
mha_img = sitk.ReadImage('train/12399485.mhd')
img_arr = sitk.GetArrayFromImage(mha_img)# ndarray

level = -200  # 窗位
window = 1600  # 窗宽

window_minimum = level - window /2
window_maximum = level + window /2
img_arr[img_arr < window_minimum]= window_minimum
img_arr[img_arr > window_maximum]= window_maximum

mha_img = sitk.GetImageFromArray(img_arr)
sitk.WriteImage(mha_img, 'train/12399485-pro.mhd')

调整12399485.mhd的窗位与窗宽，并另存为12399485-pro.mhd，此时也会在所在文件夹生成相应的12399485-pro.raw

直接切片的图片：
在这里插入图片描述

调整为肺窗后再切片的图片就变为：
在这里插入图片描述

friedrichor
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自己写的mhd raw metaimage java读取类
01-06
自己写的mhd+raw格式 metaimage java读取类
在 python 中读取 *.mhd/*.raw 格式
最新发布
wangbadan121的专栏
06-20 432
请注意，这个示例假设MHD文件中的数据类型是支持NumPy直接读取的类型（如'int32'、'float32'等），并且RAW文件的字节顺序与系统默认字节序一致或不需要交换。在Python中读取`.mhd`和`.raw`格式的文件通常涉及到两个主要步骤：解析MHD文件以获取数据的基本信息和结构，然后根据这些信息读取对应的RAW数据文件。接下来，我们根据解析得到的元数据来读取RAW数据。对于`.raw`格式的数据，通常是连续的字节流，需要根据元数据中的尺寸和数据类型进行解码。### 1. 解析MHD文件。
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读取mhd和raw文件，并将3D图片切片，同时归一化到0-255并保存为新的图片
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        本文主要内容为使用SimpleITK进行*.mhd和*.raw格式dicom文件的读取。         一个dicom文件一般分为metadata和image两部分，根据patient，study，series和image四层信息进行解析序列中的每一个dicom文件。      &n
mhd和raw文件打开
07-20
### 回答1： MHD文件和RAW文件都是常见的用于存储医学图像数据的文件格式。下面是它们如何被打开的解释： MHD（MetaImage Header）文件是一种元数据文件，通常与RAW文件一起使用，用于描述和存储医学图像的基本信息和元数据。MHD文件是一个文本文件，包含图像的维度、像素值的数据类型、像素间距和文件名等信息。要打开MHD文件，我们可以使用文本编辑器打开文件，查看其中的元数据。 RAW文件是一种包含像素值的二进制图像文件，它通常存储了由医学成像设备生成的原始图像数据。这些文件不包含头部信息，因此需要配合MHD文件使用以获取图像的相关信息。要打开RAW文件，我们可以使用图像处理软件或编程语言中的相应库来读取二进制数据，并使用MHD文件中的元数据来解释和处理图像。 总结来说，如果我们只想查看图像的相关信息，可以打开MHD文件，并使用文本编辑器查看其内容。如果我们想访问和处理图像的原始像素值数据，我们需要首先打开MHD文件以获取图像的元数据，然后使用相应的软件或编程语言读取相关的RAW文件，并使用元数据解释和处理图像数据。 ### 回答2： MHD和RAW是两种常见的文件格式，用于存储医学图像或其他科学数据。MHD文件是MetaImage文件的简写，它是一个文本文件，用于存储图像的元数据信息以及指向原始数据文件的链接。而RAW文件则是原始数据文件，包含未经过处理的图像或科学数据的原始二进制数据。 要打开MHD文件，我们可以使用不同的软件。其中一种流行的软件是SimpleITK，它是一个用于处理医学图像的强大的开源库。我们可以使用SimpleITK库中的ReadImage函数来读取MHD文件。读取后，我们可以通过获取其像素数组来访问图像的数据。 另一方面，要打开RAW文件，我们可以使用一些图像处理软件，如ImageJ或Fiji。在这些软件中，我们可以导入RAW文件并指定图像的大小、尺寸和数据类型。然后，我们可以将原始数据解析为图像，并使用相应的图像处理功能进行分析或视觉化。 需要注意的是，在打开MHD或RAW文件之前，我们需要有相应的软件或库来处理这些文件。因此，如果我们打算使用这些文件，我们需要先安装适当的软件，并了解如何使用它们来打开和处理这些特定文件格式。 ### 回答3： MHD (MetaImage Header) 文件和 RAW (Raw Image Data) 文件是用于存储医学图像的两种常见格式。 MHD 文件是一种元数据文件格式，用于描述和存储医学图像的信息。它通常包含图像的大小、像素类型、空间方向、像素间距等信息。MHD 文件本身并不存储原始图像数据，而是通过引用外部 RAW 文件来访问。 RAW 文件存储了医学图像的原始像素数据，它不包含任何元数据。通过组织像素数据的方式来呈现图像，RAW 文件没有进行任何图像处理或压缩。由于没有元数据的附加开销，RAW 文件通常比其他格式更小。 要打开 MHD 文件，通常需要一个支持该格式的特定软件或工具。这些软件可以读取 MHD 文件中的元数据，并使用其中的信息来加载和解析关联的 RAW 文件。一旦打开 MHD 文件，图像软件可以使用 RAW 文件中的原始数据进行图像处理、分析和显示。 要打开 RAW 文件，可以使用一些专门的图像处理软件或医学影像软件。这些软件通常支持多种图像格式，并具有加载和解析 RAW 文件的能力。打开 RAW 文件后，可以对图像进行处理、调整、测量或进行其他分析操作。 总之，MHD 和 RAW 文件是一对常见的医学图像文件格式。MHD 文件存储元数据信息，而 RAW 文件则存储原始像素数据。要打开这些文件，需要使用支持这些格式的特定软件或工具。

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