问题描述
物种分布数据往往有很多点位,这些点位可能是重复的,需要删除以消除过拟合。
如果是删除完全一致的点位可以在Excel里进行,熟练使用Excel的话会很快。但是如果有ENMTools工具的话,则可以一键删除,如果有很多个物种,则Excel比较麻烦,使用ENMTools效率会很快。
操作步骤
这是工具页面,需要提前进行配置
点击options-ENMTools options
然后就可以进行删除重复点位。
点击ENM measurements and tools - Trim duplicate occurrences(没法截图)。
右下角的exact match和grid cell 的区别:。如果选择“exact match”选项,则只会删除具有完全相同纬度和经度的出现项,并且输出⽂件名将以“_nodupes_exact.csv”结尾。如果选择“grid cell ”方法,则当按下“GO”按钮时,ENMTools 会要求提供 .asc ⽹格⽂件。此选项将修剪出现项数据,以便每个⽹格单元只保留一个点,并且每个剩余点都会移动到其⽹格单元的中心。使⽤此选项时,输出⽂件名以“_nodupes_grid.csv”结尾。
add files添加点位数据csv,格式如下,可以看到有很多重复点
点击save files list 选择保存文件的位置,点击go,等待软件完成,可以看到共有1092行,删除989个点位
下面是输出文件,它是和输入的那个csv在一个文件夹,最终结果如下