问题描述
很多用maxent和arcgis做物种适生区(适宜生境、栖息地适宜性)的教程,有一步划分适宜区和非适宜区时,直接使用自然断点法,或者用0.5这种中间值。
但是,在阅读文献时我发现,在很多文献中使用的是maxent模型输出结果中的“最大训练敏感性和特异性”值(maximum training sensitivity plus specificity,MTSS)以及“平衡训练遗漏率、预测面积及阈值”(balance training omission, predicted area and threshold value, BTPT)。
于是我又去网上查找相关教程,但是并没有相关教程。
下面是我自己摸索的经验。
解决思路
在做完maxent建模后,我们会得到这些文件,下面是我做十次重复的结果
点开livestock-0.html,(注意不是livestock.html)
可以看到这个表格,其中的最大训练敏感性和特异性”值(maximum training sensitivity plus specificity,MTSS)以及“平衡训练遗漏率、预测面积及阈值”(balance training omission, predicted area and threshold value, BTPT)就是我们想要的。
如果是下面这样的结果,那么适生区和次生区的阈值就是0.144和0.05
但是,我做了十次重复,因此想要十次平均的值。在刚才的结果文件夹里往下翻,找到并点开这个Excel:maxentResults.csv
文件内容是这样的,第一列是两个物种十次的结果(0-9)以及平均值(average),我们要找的阈值就在平均值(average)这一行
往右边翻,找到Maximum training sensitivity plus specificity Logistic threshold,这个0.2281就是panda的适生区和次适生区的阈值;0.2657就是livestock的适生区和次适生区的阈值
继续往右边翻,找到Balance training omission, predicted area and threshold value Logistic threshold,这个0.0465就是panda的次适生区和不适生区的阈值;0.0565就是livestock的次适生区和不适生区的阈值
当然,也有些文章只划分适生区和不适生区,那直接用小的那个值(刚刚查找的第二个值)就行